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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004043`

染色体: Chr02 坐标: 62741038-62747673 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004043`
名称	SmilChr02G004043
描述	1,4-alpha-glucan-branching enzyme-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62741038 - 62747673 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010976`
GeneID	`131010976`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010976`
原始查询	`LOC131010976`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1,4-alpha-glucan-branching enzyme-like
产物	1%2C4-alpha-glucan-branching enzyme-like
Arabidopsis	`AT2G36390` (SBE2.1) starch branching enzyme 2.1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818212] identity=58.3; qcov=0.83; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0726400` (SBE1) - identity=77.7; qcov=0.862; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003844 (1,4-alpha-glucan branching enzyme activity); GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005978 (glycogen biosynthetic process); GO:0043169 (cation binding)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00128 (Alpha-amylase); PF02806 (Alpha-amylase_C); PF02922 (CBM_48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010976

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057794680.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057794680.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794680.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794680.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794680.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62741197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:62742139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr2:62743759`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B99
`Chr2:62743759`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B99
`Chr2:62743807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr2:62744348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr2:62744577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr2:62747491`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	32	A18,A21,A3,A5,A7,A8,B101,B112,B114,B17,B24,B33,B38,B39,B4,B40,B53,B62,B71,B85,C11,C31,C33,C45,C46,C53,C57,C69,C78,C79,C80,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794680.1

827 aa

414

827

CBM_48

Alpha-amylase

Alpha-amylase_C

PF02922 CBM_48 139-221 aa PF00128 Alpha-amylase 311-379 aa PF02806 Alpha-amylase_C 672-773 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794680.1`	Pfam	`PF02922`	CBM_48	Domain	139	221	1.5e-19	70.8	Carbohydrate-binding module 48 (Isoamylase N-terminal domain)
`XP_057794680.1`	Pfam	`PF00128`	Alpha-amylase	Domain	311	379	1.9e-13	51.1	Alpha amylase, catalytic domain
`XP_057794680.1`	Pfam	`PF02806`	Alpha-amylase_C	Domain	672	773	2.5e-21	76.5	Alpha amylase, C-terminal all-beta domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938697.1
GGGGCAAATATGCCCAATCGTATAAGTTGGCTGTGGCATTAAGCAAAATCCCGTGGCATAATCTCAGGCAGAGCTCAAGATTAAAAAGTTGCTGAAATGCAAAGTCATGTGAGCTCATCCTCTCTACAGTTCGCTCTGTAAACTAATTCTCGAAGAAATGTACAGTTCGTGCAATCCGCTGTATGCACCTGCTCTTCATTCTTCACCTCCGATTCCACGTCAATTCTCCTCACTGGCATCAGTTAGTGGTAGGTGCATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010976
ATGTACAGTTCGTGCAATCCGCTGTATGCACCTGCTCTTCATTCTTCACCTCCGATTCCACGTCAATTCTCCTCACTGGCATCAGTTAGTGGTAGGTGCATTTCTAAGCAACCTTCTGGACTCATAATTAATTCTCAAAAATTACAAGCAAATAGCAGAGCTACTTCCTTGTCCAGAATTATAGCACATGGAAAGGCCGACAGATCTTCTGTCTCTGCAGTTTTAACTGATAACAGTTCACCTGTAGTAAAGATGGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794680.1
MYSSCNPLYAPALHSSPPIPRQFSSLASVSGRCISKQPSGLIINSQKLQANSRATSLSRIIAHGKADRSSVSAVLTDNSSPVVKMDEVAENMTIFSLDPSLEAYKDHFKYRMRTFTDQKMLIEKHEGSLEEFAQGYLRFGFNHKEGCIVYREWAPAAQEAEVIGDFNGWNGATHKMEKDQFGVWSVRIPDIGGNPAIPHNSRVKFRFKHSNGVWVDRIPAWIKYATRDPTKFAAAYDGVYWDPPPTERYQFKYPRPPKPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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