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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004048`

染色体: Chr02 坐标: 62812569-62814627 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004048`
名称	SmilChr02G004048
描述	glycosyltransferase family 92 protein RCOM_0530710
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62812569 - 62814627 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010981`
GeneID	`131010981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010981`
原始查询	`LOC131010981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosyltransferase family 92 protein RCOM_0530710
产物	glycosyltransferase family 92 protein RCOM_0530710
Arabidopsis	`AT4G37420` (AT4G37420) glycosyltransferase family protein (DUF23) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829896] identity=48.6; qcov=1.02; evalue=1.53e-175; confidence=high
Rice	`Os06g0727900` - identity=44.3; qcov=1.01; evalue=1.72e-136; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01697 (Glyco_transf_92)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057794686.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794686.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794686.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794686.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794686.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62812934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:62813239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C5
`Chr2:62813242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:62813348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr2:62813512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:62813557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:62813658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:62813792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B131,C48
`Chr2:62813949`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C73
`Chr2:62813949`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C73
`Chr2:62813951`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C73
`Chr2:62813951`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794686.1

537 aa

268

537

Glyco_transf_92

PF01697 Glyco_transf_92 258-474 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794686.1`	Pfam	`PF01697`	Glyco_transf_92	Domain	258	474	5.8e-30	105.4	Glycosyltransferase family 92

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938703.1
CCTAATCCTATAACAATCTTAAATTCAAGACTATTCTAATCAATAAGACAGATTTAAACACAATTACAATAAGATTTATATTTAAAGATAATTAATACACATACCAAAAATAGTCATATAAAACGATAGCCATCGCTCTTCACTCTCCTCTCCAGCAAATAAATCTCTCTCTCTCTCTCTAAAATATTGATGGCACGTAAGAAAAGCCTCCGAGCAACCTTCCTATACGTCGTCGTTTCCGTCTTCTTCTTCGCCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010981
ATGGCACGTAAGAAAAGCCTCCGAGCAACCTTCCTATACGTCGTCGTTTCCGTCTTCTTCTTCGCCTCTCTCTACCACTACCTCCACGACGCCGTCTCCACCTTCTCCTCCACCGCCATCATCTCCTTCTCCGCCGCCACCAAAACCCCCTTCCACCGCCGCTCACTCGCCACCACCGCCGTCCTCGTCCACGACTGGCAGGTCCTCGTCATCCTCTCGCCGGAGACGCCGCCTCCGCCGAATCTCGACGGCTACTCCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794686.1
MARKKSLRATFLYVVVSVFFFASLYHYLHDAVSTFSSTAIISFSAATKTPFHRRSLATTAVLVHDWQVLVILSPETPPPPNLDGYSCLFHTNEISPARFSGTLPFPDRATFTCLFPVRARRSAPFRQPVLLRTQVKPPAIAAARPPLPLWSNLVYDSLTTDDDVVLFVKGIHTRQGSNRRPSEFRCVFFSDATEGVRTAVTHSKQEVFRCGRPPLTAVSTGKELVKVTLEIVAENRVVPSVAYYTPPRKLAPNGGKALLC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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