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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004227`

染色体: Chr01 坐标: 60643350-60645566 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004227`
名称	SmilChr01G004227
描述	uncharacterized SmilChr01G004227
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60643350 - 60645566 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011007`
GeneID	`131011007`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011007`
原始查询	`LOC131011007`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0231700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0231700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G40087` (AT1G40087) Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721] identity=24.6; qcov=0.713; evalue=7.33e-10; confidence=weak
Rice	`Os12g0231700` - identity=29.1; qcov=0.613; evalue=2.57e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011007

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794727.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794727.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794727.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794727.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794727.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60643400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B71
`Chr1:60643598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:60643698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr1:60644033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B71,C62
`Chr1:60644033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C62
`Chr1:60644052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr1:60644890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:60644900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B35,B84,C74
`Chr1:60644961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr1:60644985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr1:60645018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:60645189`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A3,B104,B48,C79,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794727.1

359 aa

180

359

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 160-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794727.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	160	286	2.9e-17	63.9	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938744.1
ATGGATGAAGATTTTCAAGAAGAGTTGGTGGAACCATCAATGGAGGAAACAATAATTTCACAACACGATACGGCTAATGGTGCGCCCAAACGGAAAGTCAGAGGTGTTACGAAAGGCTTATCACTCCAAAAGAAATGTCAGCGTACTCCAAAATTAGACGTGATTATACATCCGACAAGAAATCGAATTGTTGGCGAGAATGCTAAAGACTTCAAGACAGAAGCGTGTGTGATGGTAAAACAATTTGCACAAGTTCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011007
ATGGATGAAGATTTTCAAGAAGAGTTGGTGGAACCATCAATGGAGGAAACAATAATTTCACAACACGATACGGCTAATGGTGCGCCCAAACGGAAAGTCAGAGGTGTTACGAAAGGCTTATCACTCCAAAAGAAATGTCAGCGTACTCCAAAATTAGACGTGATTATACATCCGACAAGAAATCGAATTGTTGGCGAGAATGCTAAAGACTTCAAGACAGAAGCGTGTGTGATGGTAAAACAATTTGCACAAGTTCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794727.1
MDEDFQEELVEPSMEETIISQHDTANGAPKRKVRGVTKGLSLQKKCQRTPKLDVIIHPTRNRIVGENAKDFKTEACVMVKQFAQVQHPRWKDIPMENKRKMWIGMKQKFNLEEDVHVKKVVFHQFNRQYRSYRHKLHVHYLENKGERTILDKSPHGVNREDWKLLIDYFESDAFKKISGRNKENRQKLTMNHSCGTKSIAQACYEERDPETGEEPTRTAAWRKSRYNNEKKQWVDDASKEVYEKLIMCQSLPEDGGEPMT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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