当前解析结果
SmilChr02G004102| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004102 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004102 |
| 描述 | cell division control protein 2 homolog D |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 63337866 - 63340293 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011032 |
|---|---|
| GeneID | 131011032 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011032 |
| 原始查询 | LOC131011032 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cell division control protein 2 homolog D |
| 产物 | cell division control protein 2 homolog D |
| Arabidopsis | AT1G20930 (CDKB2;2)cyclin-dependent kinase B2;2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838687] identity=86.3; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os08g0512600 (CDKB2)- identity=78.8; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0000082 (G1/S transition of mitotic cell cycle); GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0004693 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007165 (signal transduction); GO:0010389 (regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle); GO:0010468 (regulation of gene expression); GO:0030332 (cyclin binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011032 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057794753.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057794753.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057794753.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057794753.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057794753.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:63338812 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr2:63339261 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B104,B140,C17 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057794753.1PF00069
Pkinase 12-302 aa
PF07714
PK_Tyr_Ser-Thr 14-216 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057794753.1 |
Pfam | PF00069 |
Pkinase | Domain | 12 | 302 | 8.2e-68 | 229.4 | Protein kinase domain |
XP_057794753.1 |
Pfam | PF07714 |
PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 14 | 216 | 1.2e-27 | 97.6 | Protein tyrosine and serine/threonine kinase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。