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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004118`

染色体: Chr02 坐标: 63471430-63473427 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004118`
名称	SmilChr02G004118
描述	protein translation factor SUI1 homolog 2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63471430 - 63473427 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011045`
GeneID	`131011045`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011045`
原始查询	`LOC131011045`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein translation factor SUI1 homolog 2
产物	protein translation factor SUI1 homolog 2
Arabidopsis	`AT1G54290` (AT1G54290) Translation initiation factor SUI1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841870] identity=89.4; qcov=1; evalue=9.17e-75; confidence=high
Rice	`Os07g0529800` (GOS2) - identity=89.6; qcov=1.02; evalue=1.68e-73; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0006413 (translational initiation)
KEGG	-
Pfam	PF01253 (SUI1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011045

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794772.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794772.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057794772.1`
4	Nucleolus	核仁	0.60000	`XP_057794772.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057794772.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63472681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B20,B34,C16
`Chr2:63472708`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B130
`Chr2:63472708`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794772.1

113 aa

113

SUI1

PF01253 SUI1 28-102 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794772.1`	Pfam	`PF01253`	SUI1	Domain	28	102	5.7e-27	94.7	Translation initiation factor SUI1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938789.1
TATCCCTCTATTTACCTCAAAATGTACCAACTTTGGTTTATAATCGCTAGAATATTTTGCGACTTATGGACGTAATCCTATAAGATTCTTCTTGCTGCTTCCAAAGCTCATTCTGTTTCCTCTCCCATCTCTTTGTGCCAATTAATTCTCTTTCTTCTTTACCCGAGCAGGTCTGAGCGTTTAAATCTAGTTGCAGGAAATCGTGTTCCCTTGTACGGTTGCTGCATCAACCAATTTTCATGTCTGATCTTGATATCCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011045
ATGTCTGATCTTGATATCCAGATTCCTACTACTTATGATCCTTTTGCTGATGCAAATGCTGAGAACTCTGGTGCTGGAACAAAAGAGTACGTACACATTCGGATACAGCAACGAAATGGCCGGAAAAGCCTGACTACTGTGCAGGGATTGAAGAAAGAGTTCAGCTATAACAAAATCTTGAAGGATCTTAAGAAAGAGTTTTGCTGCAATGGAACTGTTGTCCAGGATCCGGAATTAGGCCAAGTTATACAACTCCAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794772.1
MSDLDIQIPTTYDPFADANAENSGAGTKEYVHIRIQQRNGRKSLTTVQGLKKEFSYNKILKDLKKEFCCNGTVVQDPELGQVIQLQGDQRKNVSTFLVQAGIVKKDHIKIHGF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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