当前解析结果
SmilChr02G004119| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004119 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004119 |
| 描述 | DNA repair RAD52-like protein 2, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 63473998 - 63478395 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011049 |
|---|---|
| GeneID | 131011049 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011049 |
| 原始查询 | LOC131011049 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | DNA repair RAD52-like protein 2, chloroplastic |
| 产物 | DNA repair RAD52-like protein 2%2C chloroplastic |
| Arabidopsis | AT5G47870 (RAD52-2)cobalt ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834838] identity=76.5; qcov=0.74; evalue=4.56e-78; confidence=high |
| Rice | Os03g0851500 (OsRad52-2a)- identity=66; qcov=0.735; evalue=1.33e-64; confidence=high |
| GO | GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0003677 (DNA binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011049 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057794779.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.80000 | XP_057794779.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057794779.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057794779.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057794779.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:63474854 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B34,C36 |
Chr2:63474855 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B10,B69 |
Chr2:63474862 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B138 |
Chr2:63478235 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B50,C23 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。