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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004128`

染色体: Chr02 坐标: 63522595-63526785 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004128`
名称	SmilChr02G004128
描述	uncharacterized SmilChr02G004128
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63522595 - 63526785 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011054`
GeneID	`131011054`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011054`
原始查询	`LOC131011054`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G31150` (AT1G31150) K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000] identity=24.7; qcov=0.614; evalue=6.27e-11; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011054

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794784.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057794784.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794785.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057794784.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057794784.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63523602`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B22,B63,B83
`Chr2:63523602`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B22,B63,B83
`Chr2:63523607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C2
`Chr2:63523629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C75,D1
`Chr2:63523643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B46,C17,C49,C81
`Chr2:63523692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	37	A14,A21,A25,A8,B10,B113,B120,B127,B129,B134,B20,B23,B31,B34,B38,B39,B43,B45,B56,B62,B85,B96,C13,C18,C19,C29,C31,C43,C44,C54,C57,C69,C76,C79,C80,C83,C84
`Chr2:63523711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C23
`Chr2:63523729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B45
`Chr2:63523738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B82,C34,C79
`Chr2:63523746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B58,B82,C9
`Chr2:63523747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B133,B20,B66,C84
`Chr2:63523747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B20,B66,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794785.1

316 aa

158

316

DUF8566

DUF1985

PF29561 DUF8566 56-233 aa PF09331 DUF1985 78-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794785.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	56	233	2.7e-08	34.6	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057794785.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	78	212	4.6e-15	56.6	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938802.1
TCCGCGTCGACTCTCGCCATCCCTCTCGGCTCTCTACCGGCGAACTATCGGCTTTCTACCGCCTGAAATCTCGTCAGCTTCTCTCTCGCCTCTCTCCATTTGCGTCATGGATGCACCGCAAGAGGAGAATTCTAATTATTTAAGGCCGAGTACAATTAATGTGGCTTCAAATGTTGGGACATATTACAAGACAAAATACTTGAAAACGGTTAGGAAGGTATTGAATGCGAAAGGTGGTCAACCGTTGGTGGACAGATTTT...

XM_057938801.1
TGTATGGTCCCTTGAGATCATACCCGAGTTGGGTACTGCAGTTGGTACACACTTGGATGGCGGTGCACACCCCAGATGTTTGAGGTGGAGGTTTCGAAGTAGGCCCACTGTGTCGGATTTACGCCTCCTATTCGAGCAAGAGCCGCATCATATATTGGCGATCCAGCCCGACGATTATGAGATGACGACCCATTATTATGCTACGGCAGTCATGCCCGTGCCCATTGGTGTCACTATGAGCGACCGATGAACCCGTTGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011054
ATGGATGCACCGCAAGAGGAGAATTCTAATTATTTAAGGCCGAGTACAATTAATGTGGCTTCAAATGTTGGGACATATTACAAGACAAAATACTTGAAAACGGTTAGGAAGGTATTGAATGCGAAAGGTGGTCAACCGTTGGTGGACAGATTTTTAAGTGGTTGTTTCGGACACTTATTAGATTGGAATCCGGGGTCAAAGTGTGCTATGGCTGTTCACCATGTAGTTTCTCGCCAAATCCGATCAAATGATAATGGATT...

LOC131011054
ATGGGAGAAGAGCAGGAGATCAGAATGAAAAGGCATAACGAGGATATGGAGAGTCGAGTGAAGAGGGCATTGAAGGGTTTTTTGGAGGATTTGAAGGGGTTTTTTGGCTGTAGGTCTGTACACCCTAGAGGTGTATATTCTCCTGCCCCTCGTCGCACGCCTGCACCAGAGACCAGAGATTCTGATGATGGGCAACCCGATGATGGTGGTCCGGTGGTCGGTGATGTGTCACCTCATGATGATGAGCCACTACAGGTGCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057794784.1
MGEEQEIRMKRHNEDMESRVKRALKGFLEDLKGFFGCRSVHPRGVYSPAPRRTPAPETRDSDDGQPDDGGPVVGDVSPHDDEPLQVPHRHSVHEYGSTSTSHHEQPHFSLQNPSDYNFDPRYMEHVAQGLMSGMGVVTTEGLQNLLFDHFQTPAMPRRSERQRFPSRLLDSPYLATGEPCLLPKKVVDKFMEYMNGREEYVFITESSVKYKKGYFHDILRLNFSFPEEVVELFMLSCKSRLMTGGNLLPNVTSKSTVISS...

XP_057794785.1
MDAPQEENSNYLRPSTINVASNVGTYYKTKYLKTVRKVLNAKGGQPLVDRFLSGCFGHLLDWNPGSKCAMAVHHVVSRQIRSNDNGLWFFINGSRLNFSERDYALVTRLNFGETDFDTRAHHDLRNVEVFRKFCCGQRTVKVETLVDLFENYDIDDEDGSLLLRVANVLVLYGMLLGYEPDKNVVDWVWALVNDLDAFAQFPWAAYSYQLLCQYVNNSSTHDKYKLYGPVWALHVWSLEIIPELGTAVGTHLDGGAHPRC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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