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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004130`

染色体: Chr02 坐标: 63558436-63560455 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004130`
名称	SmilChr02G004130
描述	aldehyde oxidase GLOX-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63558436 - 63560455 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011058`
GeneID	`131011058`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011058`
原始查询	`LOC131011058`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aldehyde oxidase GLOX-like
产物	aldehyde oxidase GLOX-like
Arabidopsis	`AT1G75620` (AT1G75620) glyoxal oxidase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843897] identity=61.2; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0258900` - identity=58.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07250 (Glyoxal_oxid_N); PF09118 (GO-like_E_set)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011058

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057794789.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794789.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794789.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794789.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794789.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63558594`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A7
`Chr2:63558594`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A7
`Chr2:63558601`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A7
`Chr2:63558601`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A7
`Chr2:63558759`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B83
`Chr2:63558759`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B83
`Chr2:63558760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr2:63558794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr2:63558856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B120,C59
`Chr2:63559014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr2:63559029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr2:63559044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794789.1

543 aa

272

543

Glyoxal_oxid_N

GO-like_E_set

PF07250 Glyoxal_oxid_N 42-427 aa PF09118 GO-like_E_set 436-541 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794789.1`	Pfam	`PF07250`	Glyoxal_oxid_N	Repeat	42	427	3e-183	609.5	Glyoxal oxidase N-terminus
`XP_057794789.1`	Pfam	`PF09118`	GO-like_E_set	Domain	436	541	3.1e-26	92.3	Galactose oxidase-like, Early set domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938806.1
TCTAATTGGATAAAGAGACAGCATGAGACATACATATAGTTTAATTTGTAGGTGTTTTGAGTCAAACATAATGAATGGAACATTCTAAGCCATATAACCAACACCAGCACGCACCAACCAACCAAATACATAGCTTACACAATATAAAATCAGAAATTCTCTTGTATATAAAGTGGGTAGCTAGCTAGGCAGATTCATCAACACAAACCATCCATCTCAAAAAAAAAGAAAAAGGAAAACATCAACATCGATGATGGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011058
ATGATGGCCAAGTTTATTGGTTTCCTCGTACTAGTCTTGTTAATGCAAATGATGATTCCGAAAGCAGCTGGTGCCGGCGGCGGCAAGTGGAACCTCTTACGGTCAAACATCGGGGTGTCTGCCATGCACATGCAGCTGCTGAACAACGATCGTGTTGTGATCTTCGACCTCACTGATTTCGGGCCCTCAAACATCTCCCTCCCAAACAACCGCTGTCGCGACAACCCCAACGATCTGACACTCCAACACGATTGCACGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794789.1
MMAKFIGFLVLVLLMQMMIPKAAGAGGGKWNLLRSNIGVSAMHMQLLNNDRVVIFDLTDFGPSNISLPNNRCRDNPNDLTLQHDCTAHSVEYNVATNSIRPLYVYSNVWCSSGAAMPDGSLLQTGGFNDGYNTVRVFKPCNDASCDWQEFNNVLTHRRWYATNHILPDGRQIIFGGRDRFSYEFYPKRSGADLAIELPFLRATRDPTIENNLYPFVFLNVDGNLFIFANNRAILFDYVRGVVVRTYPTIPGGDPRNYPSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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