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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004174`

染色体: Chr02 坐标: 64035262-64036151 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004174`
名称	SmilChr02G004174
描述	chaperone protein dnaJ 11, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64035262 - 64036151 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011096`
GeneID	`131011096`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011096`
原始查询	`LOC131011096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ 11, chloroplastic-like
产物	chaperone protein dnaJ 11%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G36040` (J11) Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829760] identity=55.8; qcov=0.738; evalue=4.83e-32; confidence=medium
Rice	`Os03g0244950` - identity=53.5; qcov=0.716; evalue=2.02e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011096

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057794849.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057794849.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794849.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794849.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794849.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64035567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,B78,B79
`Chr2:64035575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr2:64035710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr2:64035744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B75,B79
`Chr2:64035787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:64035791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B76,C44,C51,C87
`Chr2:64035804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B69,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794849.1

141 aa

141

DnaJ

PF00226 DnaJ 55-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794849.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	55	116	1.4e-21	77.0	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938866.1
ATAAGTATTTTAAGTTTAAACCACTACTCTTTTTTTTTTTTTTTCCATTGCGCGTCTTCGAAGTTAGTCATGTGTTTTTCATCATCAATTTAGCTGAAGTTAAGTTTAATCAATCAAATCCATTAATTTGGTTGGAACAGATAAAAGAAAAAAGAAAATAAACCCAACAATGAATACCTTCCACTACTACTCTATATATTCCACCTTAAACACAAAACGCATCAATCATCACCTCTCACACATTTCTGCGTTTTCCTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011096
ATGGCTTCCTCCACATCATTTTCCCTCCACAGCAAGCTATTCTCCCGCCGCTTCACCGCCAATCCGCCCCCGCATTCTCCGATTACTCTCCGGAGCTCGCTCCGCATCTCCGCCGGCTACGCCACCGCGGAGATAAGCAGGACCGCCTCCCAGGCGGCGTCGTGCTACGACGTGCTAGGGATCGACGCCGGCGCAACTTTCCAGGAAATCAAGTCCGCCTACCGGAAGCTGGCGCGGACTTTGCACCCCGACGTCGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794849.1
MASSTSFSLHSKLFSRRFTANPPPHSPITLRSSLRISAGYATAEISRTASQAASCYDVLGIDAGATFQEIKSAYRKLARTLHPDVANKGGETADEFIRVHAAYSTLSDPEKRAVYDNSLSWRRRPATVTPRGRSWETDQCW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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