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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004178`

染色体: Chr02 坐标: 64068322-64072231 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004178`
名称	SmilChr02G004178
描述	uncharacterized SmilChr02G004178
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64068322 - 64072231 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011100`
GeneID	`131011100`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011100`
原始查询	`LOC131011100`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0250700; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os04g0250700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G24175` (AT4G24175) kinesin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828518] identity=43.8; qcov=0.969; evalue=5.45e-57; confidence=medium
Rice	`Os04g0250700` - identity=54.2; qcov=0.784; evalue=3.57e-65; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04751 (DarP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011100

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057794853.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057794853.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794854.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794854.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794854.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64068709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:64068756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B32
`Chr2:64068835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B87,C19,C36
`Chr2:64068843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A6,B120,B77,C83
`Chr2:64069433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr2:64071974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B32,B69
`Chr2:64072114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,C44,C51,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794853.1

291 aa

146

291

DarP

PF04751 DarP 84-282 aa

XP_057794854.1

259 aa

130

259

DarP

PF04751 DarP 84-242 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794853.1`	Pfam	`PF04751`	DarP	Family	84	282	5.7e-30	104.9	Dual-action ribosomal maturation protein DarP
`XP_057794854.1`	Pfam	`PF04751`	DarP	Family	84	242	1.8e-23	83.8	Dual-action ribosomal maturation protein DarP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096737.1
GCCCATAGCCAACTGGACCTAAGCTTCACAATTTCACAGAAAGCCCGATTTCATTCAGTGAAACCGCACCGGAGAATGGCTCACCTACTGCGGCCGCTCTTTCAGTGGCCACGGTGGCGCCACCGTTGCTCCACCTTCTCGCAAATCCTCAGCTTCCATTCGTCTCCGCCACGCGCCACCACTACTCTTTCTTTCCTCGCATTCTTCTCTACCACATGCCGCCAAGTCCATTTCCGCGCACGCGCTCCGAAATTGCGCGA...

XM_057938871.1
GCCCATAGCCAACTGGACCTAAGCTTCACAATTTCACAGAAAGCCCGATTTCATTCAGTGAAACCGCACCGGAGAATGGCTCACCTACTGCGGCCGCTCTTTCAGTGGCCACGGTGGCGCCACCGTTGCTCCACCTTCTCGCAAATCCTCAGCTTCCATTCGTCTCCGCCACGCGCCACCACTACTCTTTCTTTCCTCGCATTCTTCTCTACCACATGCCGCCAAGTCCATTTCCGCGCACGCGCTCCGAAATTGCGCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011100
ATGGCTCACCTACTGCGGCCGCTCTTTCAGTGGCCACGGTGGCGCCACCGTTGCTCCACCTTCTCGCAAATCCTCAGCTTCCATTCGTCTCCGCCACGCGCCACCACTACTCTTTCTTTCCTCGCATTCTTCTCTACCACATGCCGCCAAGTCCATTTCCGCGCACGCGCTCCGAAATTGCGCGATTCTCCTCCGCTCTCCGACGCTAATGAGAGCGACGATGAATCATCTGATGGTAGTAGCGATGTAAAGAAGAGCCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057794853.1
MAHLLRPLFQWPRWRHRCSTFSQILSFHSSPPRATTTLSFLAFFSTTCRQVHFRARAPKLRDSPPLSDANESDDESSDGSSDVKKSRNEKKREARRAVRWGMDLANFSPFQIKRILRVADLEQEVFEAIMVVKRLGRDVREGKRRQYNYIGRLLRGVEPELMDGLIQAIKDGDQSKFQDLSGTELPIDNDEEAEREVSEEEEEEDFTNMAAVTRWFDGLINKDIDITNEIYSLREVDFDRQELRQLVRKVQSALEQEAGL...

XP_057794854.1
MAHLLRPLFQWPRWRHRCSTFSQILSFHSSPPRATTTLSFLAFFSTTCRQVHFRARAPKLRDSPPLSDANESDDESSDGSSDVKKSRNEKKREARRAVRWGMDLANFSPFQIKRILRVADLEQEVFEAIMVVKRLGRDVREGKRRQYNYIGRLLRGVEPELMDGLIQAIKDGDQSKFQDLSGTELPIDNDEEAEREVSEEEEEEDFTNMAAVTRWFDGLINKDIDITNEIYSLREVDFDRQKDLTENKGTLRMCCTYYF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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