当前解析结果
SmilChr02G004197| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004197 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004197 |
| 描述 | proline-rich receptor-like protein kinase PERK10 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 64303365 - 64305466 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011117 |
|---|---|
| GeneID | 131011117 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011117 |
| 原始查询 | LOC131011117 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | proline-rich receptor-like protein kinase PERK10 |
| 产物 | proline-rich receptor-like protein kinase PERK10 |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011117 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057794879.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057794879.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057794879.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057794879.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057794879.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:64304601 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B133,B140,B45,B62,C1,C19,C45,C60 |
Chr2:64304625 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,B45,C78 |
Chr2:64304632 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B91,C57 |
Chr2:64304643 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B13,B76,B98 |
Chr2:64304649 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B125 |
Chr2:64304672 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B127,B73 |
Chr2:64304677 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A10,B66 |
Chr2:64304938 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B103,B4,B58,C12,C31 |
Chr2:64304941 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr2:64304943 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B132 |
Chr2:64305223 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B94 |
Chr2:64305223 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B94 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。