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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004210`

染色体: Chr02 坐标: 64364495-64368110 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004210`
名称	SmilChr02G004210
描述	probable cinnamyl alcohol dehydrogenase 6
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64364495 - 64368110 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011127`
GeneID	`131011127`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011127`
原始查询	`LOC131011127`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable cinnamyl alcohol dehydrogenase 6
产物	probable cinnamyl alcohol dehydrogenase 6
Arabidopsis	`AT4G39330` (CAD9) cinnamyl alcohol dehydrogenase 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830088] identity=57.7; qcov=0.854; evalue=5.95e-147; confidence=high
Rice	`Os04g0229100` (OsCAD6) - identity=70.6; qcov=0.867; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0009809 (lignin biosynthetic process); GO:0045551 (cinnamyl-alcohol dehydrogenase activity)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00107 (ADH_zinc_N); PF08240 (ADH_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011127

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794889.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057794889.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057794889.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057794889.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794889.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64364544`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B115,B13,C45
`Chr2:64364544`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B115,B13,C45
`Chr2:64364573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C44
`Chr2:64364604`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	94	A14,A15,A16,A2,A20,A22,A5,A9,B1,B10,B101,B103,B104,B108,B110,B115,B117,B12,B120,B127,B128,B129,B13,B131,B132,B133,B136,B14,B16,B18,B21,B23,B26,B31,B32,B34,B35,B37,B38,B39,B4,B41,B44,B46,B50,B55,B68,B73,B76,B77,B79,B80,B81,B82,B87,B91,C1,C12,C13,C18,C19,C20,C23,C29,C30,C33,C34,C36,C39,C40,C41,C43,C45,C47,C48,C49,C57,C59,C62,C64,C65,C68,C71,C79,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D4,D6,D7,D9
`Chr2:64364613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D7
`Chr2:64364638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr2:64364651`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B107
`Chr2:64364651`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B107
`Chr2:64364660`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B107
`Chr2:64364660`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B107
`Chr2:64365847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B135
`Chr2:64366006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794889.1

412 aa

206

412

ADH_N

ADH_zinc_N

PF08240 ADH_N 85-203 aa PF00107 ADH_zinc_N 244-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794889.1`	Pfam	`PF08240`	ADH_N	Domain	85	203	3.6e-27	95.4	Alcohol dehydrogenase GroES-like domain
`XP_057794889.1`	Pfam	`PF00107`	ADH_zinc_N	Domain	244	365	1.2e-21	77.7	Zinc-binding dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938906.1
AACGGCAAATATTAGTAAATAACGCCTTTTTGAATTTTATAATGGGAAAGAAAACTATCTCCTCTGACTTTTCCCACCGCTACAAACGTCCAGCAGCAAGCCCCACTCCCAACTCTTCCTCTCCTTCAATAAATTTGCATTTTCTCTCCCACTCTCTTCCACTCACATCTCTCTCTCTCTCTCTAGGTGCCATGGCTCAAACAACACCAAACCACACGCAGACTGTTTCTGGCTGGGCAGCTCATGACACATCTGGCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011127
ATGGGAAAGAAAACTATCTCCTCTGACTTTTCCCACCGCTACAAACGTCCAGCAGCAAGCCCCACTCCCAACTCTTCCTCTCCTTCAATAAATTTGCATTTTCTCTCCCACTCTCTTCCACTCACATCTCTCTCTCTCTCTCTAGGTGCCATGGCTCAAACAACACCAAACCACACGCAGACTGTTTCTGGCTGGGCAGCTCATGACACATCTGGCAAAATCACTCCATACACCTTCAGCCGCAGAGAAAATGGGGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794889.1
MGKKTISSDFSHRYKRPAASPTPNSSSPSINLHFLSHSLPLTSLSLSLGAMAQTTPNHTQTVSGWAAHDTSGKITPYTFSRRENGADDVTIKILYCGICHTDLHHAKNDWGITMYPVVPGHEIIGIITKVGCNVTNFKEGDRAGVGCLAATCLKCEYCQEGHENYCDEVQFVYNGIFWDGSITYGGYSEFLVADSRYVVRVPENLAMDAAAPLLCAGITVYSPMKDNNLLETKGKRIGVVGLGGLGHIAVKFAKAFHHHV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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