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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004211`

染色体: Chr02 坐标: 64374490-64376363 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004211`
名称	SmilChr02G004211
描述	UPF0496 protein At1g20180-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64374490 - 64376363 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011128`
GeneID	`131011128`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011128`
原始查询	`LOC131011128`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0496 protein At1g20180-like
产物	UPF0496 protein At1g20180-like
Arabidopsis	`AT1G20180` (AT1G20180) transmembrane protein (DUF677) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838607] identity=32.2; qcov=1.13; evalue=2.7e-48; confidence=low
Rice	`Os06g0718300` - identity=42.6; qcov=0.314; evalue=2.41e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05055 (DUF677)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011128

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057794891.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057794891.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057794891.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794891.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794891.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64374949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C17
`Chr2:64375219`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A1,A13,B117,C27,C3,C53
`Chr2:64375276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B34,B87,C19,C36
`Chr2:64375486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C25
`Chr2:64375559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,D10
`Chr2:64375741`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D6
`Chr2:64375741`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D6
`Chr2:64375747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C79,C85
`Chr2:64375766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr2:64375770`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C65
`Chr2:64375770`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C65
`Chr2:64375778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794891.1

344 aa

172

344

DUF677

PF05055 DUF677 95-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794891.1`	Pfam	`PF05055`	DUF677	Family	95	341	5.1e-11	42.8	Protein of unknown function (DUF677)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938908.1
CTCGATCTCGAAAAAATCTGATCACACTACGGTTGTCAGAAACTAACCTAAAAACAAGGGTTGAAATATAACTAATAGATAAGGCTAAAATTTAGCAAAAGTGGCTTTTAATTAAATGGCCCTAAACCCTTTTCCCAATTTAATTAATTACCTCTTTTCATGCAGCTAACTTCGTTTTACATTTTTCCTAGGCGATTTACACGTAGTCTGTAGCGTACAAGCAACGTTGCTGTGTATTTTGATGAAATACTCCACAGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011128
ATGTTGTCTCTTAAAAAAATCTTGAGGACGACCAAGCTCAGATCCTCCCTCGAAAAGCAAGGTGGAAATGGAAAAGACAATAGTAATTCGAGTAGCTCAACTGTTAAAACAGTGATCAACGAAGAATACAAAGAAGCGTTTAGGACAAAGTCTTACACAGAAATTAGTGACAAGATTCAAAGGCAACTCGAAACAAGAATTATTGTTGAGAGTTCTTCACCTCCACCGGAGTATTTGGTGGAACCCCGTCACGAGATCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794891.1
MLSLKKILRTTKLRSSLEKQGGNGKDNSNSSSSTVKTVINEEYKEAFRTKSYTEISDKIQRQLETRIIVESSSPPPEYLVEPRHEITSKHHHFLTDYFDTSLEAGRICESILQKIHQIRIDYEAIRSVIERDNQHTRLFKSLASFALHGNPFAAMTPQKFHDLHQNHQHFLHQLTSKRAKTKRQKKFTRFIKRAMASLGCGALALALLLLAVHGMAGVVAAPVLVVSSAVLFANREKQESKRQEQGGMEAQLDAAXRGVY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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