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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004366`

染色体: Chr01 坐标: 61844665-61845294 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004366`
名称	SmilChr01G004366
描述	metalloendoproteinase 5-MMP-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61844665 - 61845294 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011167`
GeneID	`131011167`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011167`
原始查询	`LOC131011167`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metalloendoproteinase 5-MMP-like
产物	metalloendoproteinase 5-MMP-like
Arabidopsis	`AT1G59970` (AT1G59970) Matrixin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842291] identity=28.6; qcov=0.852; evalue=8.75e-20; confidence=low
Rice	`Os02g0740700` (OsMMP1) - identity=32.1; qcov=0.789; evalue=5.35e-19; confidence=low
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0030198 (extracellular matrix organization); GO:0030574 (collagen catabolic process); GO:0031012 (extracellular matrix)
KEGG	-
Pfam	PF01471 (PG_binding_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011167

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057794951.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794951.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794951.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794951.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794951.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61844798`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A14,A21,A22,B110,B120,B122,B128,B139,B28,B30,B34,B37,B44,B46,B52,B56,B57,B58,B62,B69,B74,B77,B8,B81,B89,B91,B96,C10,C13,C19,C20,C21,C29,C34,C35,C45,C57,C60,C70,C71,D10,D4
`Chr1:61844799`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A14,B110,B120,B122,B139,B28,B30,B34,B37,B46,B56,B58,B69,B74,B96,C10,C13,C19,C20,C21,C29,C35,C45,C60,C70,D10,D4
`Chr1:61844824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:61844839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr1:61845009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:61845042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:61845104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B26,C38,C40,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794951.1

209 aa

104

209

PG_binding_1

PF01471 PG_binding_1 31-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794951.1`	Pfam	`PF01471`	PG_binding_1	Domain	31	75	1.6e-05	25.7	Putative peptidoglycan binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938968.1
ATGGCTCTTAAACCCTTCCTCACGTTCACATTCCTCTTCTTCGCGCCTATTAGCCACGTGTCATCCATCGATTTGAACTCGTCCGATTTCGCAAAAGCCTATTTGAAACACTACGGCTATCTTCAACACGCCGACGGCAACATAGAATCGGCCATGAAATTATTCCAACAGAGCCACGAAATAAGGGCCACAGCGTCATTAGACGCGGAGACCTTATCGGCGATGAAACGGCCCCGGTGCGGCGTCCCCGACGTGGCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011167
ATGGCTCTTAAACCCTTCCTCACGTTCACATTCCTCTTCTTCGCGCCTATTAGCCACGTGTCATCCATCGATTTGAACTCGTCCGATTTCGCAAAAGCCTATTTGAAACACTACGGCTATCTTCAACACGCCGACGGCAACATAGAATCGGCCATGAAATTATTCCAACAGAGCCACGAAATAAGGGCCACAGCGTCATTAGACGCGGAGACCTTATCGGCGATGAAACGGCCCCGGTGCGGCGTCCCCGACGTGGCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794951.1
MALKPFLTFTFLFFAPISHVSSIDLNSSDFAKAYLKHYGYLQHADGNIESAMKLFQQSHEIRATASLDAETLSAMKRPRCGVPDVAGGVNLMQRNRSAYALIPGHPKWPFFQLSYVLRNFPDAAKPQLESALDKWSHVSGFTFSENKGFYDHDLSIGFYRLGHGDRTRSMGRAECWPIRSRPPTVASISMMTSYGRSSPSMASLSTSRA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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