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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004488`

染色体: Chr02 坐标: 67389325-67391433 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004488`
名称	SmilChr02G004488
描述	putative UPF0481 protein At3g02645
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67389325 - 67391433 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011197`
GeneID	`131011197`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011197`
原始查询	`LOC131011197`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative UPF0481 protein At3g02645
产物	putative UPF0481 protein At3g02645
Arabidopsis	`AT3G02645` (AT3G02645) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723101] identity=43.2; qcov=1; evalue=2.72e-145; confidence=medium
Rice	`Os06g0179500` - identity=46.9; qcov=1.02; evalue=4.52e-170; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011197

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057794975.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794975.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794975.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794975.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67389517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B137
`Chr2:67389638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C30,D10
`Chr2:67389698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:67389709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B37,C11,C47,C69
`Chr2:67389710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B37,C11,C47,C69
`Chr2:67389988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C31
`Chr2:67390037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr2:67390104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr2:67390136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:67390139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B81,B9,C54,C86
`Chr2:67390140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B130,B137
`Chr2:67390378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,C11,C47,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794975.1

561 aa

280

561

DUF247

PF03140 DUF247 37-535 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794975.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	37	535	3.2e-101	340.3	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938992.1
GAATCTCGCTCGTGAACGCATTGTTTACACTAAAAAATACAAACCAAGAATATTTGACCTAGATATATAGTGCTACTTTAGTTTTAAACCTTCACATTCATCTCCTATATTTTATTACAATAACGAGTAACGAGAAACTCATTTTCGCCCACTTATGATACTATATTTAAACCACTACGTACACAACACAGCCAGTTGATTCAAAAATCCAATCTTAATTTCCAATTTCCACACCATATATGTCGACGACACAACAACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011197
ATGTCGACGACACAACAACGGCCACACTACGACGAGACGCAATGGGTGAAGCGCATCCAGCAAACCCTAGACGACGAGGTCGACGAAGAGACGGAGATCCCGGTCACCATCTTCGCCGTCCCTAAAGCCCTAATGGTGAGCGATCCGGAGTTGTACATCCCCCAACAGGTGGCGATCGGGCCGTACCACCACCTCCGGGCCGAGCTCTACGACATGGAGAGGTACAAAGTGGCCGCCGCCAAAAGAAACCAGAAGGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794975.1
MSTTQQRPHYDETQWVKRIQQTLDDEVDEETEIPVTIFAVPKALMVSDPELYIPQQVAIGPYHHLRAELYDMERYKVAAAKRNQKELQNVKLKHLVDHILKMELRIKANYHRPLGIGAEALAWMMAVDVSFLFEFMQVCAVKEGKAITRIPSRMAHLIDLSGRKTAHNAILRDIVMLENQIPLFVMRKLLELQFSSVEMADQRVHAMLTALSRDLSPFQMAETAEGAAVSECAHLLEFLYNYIVPKTDWEKPASIEIDVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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