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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000735`

染色体: Chr02 坐标: 11914723-11916619 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000735`
名称	SmilChr02G000735
描述	transcription factor BHLH094-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	11914723 - 11916619 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011218`
GeneID	`131011218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011218`
原始查询	`LOC131011218`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor BHLH094-like
产物	transcription factor BHLH094-like
Arabidopsis	`AT1G59640` (BPEp) transcription factor BIG PETAL P (BPE) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842254] identity=63.2; qcov=0.375; evalue=2.03e-25; confidence=low
Rice	`Os07g0193800` (OsbHLH094) - identity=58.2; qcov=0.444; evalue=1.01e-30; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794990.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794990.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794990.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794990.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794990.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:11914738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B76,C49
`Chr2:11914757`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	59	A16,A18,A3,A6,B10,B100,B103,B107,B109,B110,B119,B12,B126,B134,B140,B17,B30,B38,B39,B42,B43,B45,B46,B47,B5,B51,B52,B58,B6,B68,B71,B82,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B99,C1,C16,C19,C2,C22,C25,C37,C39,C40,C42,C45,C47,C5,C53,C55,C56,D6,D7,D9
`Chr2:11915226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C29
`Chr2:11915921`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B129,B2
`Chr2:11915921`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B129,B2
`Chr2:11915927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr2:11915957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B93,D11
`Chr2:11915957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,D11
`Chr2:11915974`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A9,B10,B112,B26,B82
`Chr2:11915974`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A9,B10,B112,B26,B82
`Chr2:11916398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794990.1

232 aa

116

232

HLH

PF00010 HLH 182-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794990.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	182	207	6.8e-05	23.3	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939007.1
ATGCTTATTGCGGCTGTTGGGCATCTTTATGCCTTCCCTTACAAAGAGTATGCTGGTGCAAATATAGGCTCAAATCATGGCTGGAGTGATTCAGAACTCTTTATAATATGTATGCTTGGTGTACTTGAGGGCATCTGCCGACTTTTGCTGGTGGATAGACATGGTTCTGCTCCTTTATGGCAAACATGTTCTATTGGAAACTGTAATACATGCTTAGCTTGGCCTATCTGCATGAGTGAAATGATGCATAGATCGAACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011218
ATGCTTATTGCGGCTGTTGGGCATCTTTATGCCTTCCCTTACAAAGAGTATGCTGGTGCAAATATAGGCTCAAATCATGGCTGGAGTGATTCAGAACTCTTTATAATATGTATGCTTGGTGTACTTGAGGGCATCTGCCGACTTTTGCTGGTGGATAGACATGGTTCTGCTCCTTTATGGCAAACATGTTCTATTGGAAACTGTAATACATGCTTAGCTTGGCCTATCTGCATGAGTGAAATGATGCATAGATCGAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794990.1
MLIAAVGHLYAFPYKEYAGANIGSNHGWSDSELFIICMLGVLEGICRLLLVDRHGSAPLWQTCSIGNCNTCLAWPICMSEMMHRSNDDSRKRRDGDEHCAKGGGASTSSSNGGSCNNNNNVSNERRNEGDSKRMKAVGELKVEGEGNSGKGAAAVERRSKLDELPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVRAAIKVKASVIICFTSSRKSC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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