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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000759`

染色体: Chr02 坐标: 12387290-12390391 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000759`
名称	SmilChr02G000759
描述	protein CLMP1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	12387290 - 12390391 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011239`
GeneID	`131011239`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011239`
原始查询	`LOC131011239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CLMP1
产物	protein CLMP1
Arabidopsis	`AT1G62390` (Phox2) Octicosapeptide/Phox/Bem1p (PB1) domain-containing protein / tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842537] identity=65.4; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0135400` - identity=56.9; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00564 (PB1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011239

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057795012.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057795012.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795012.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795012.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795012.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:12388225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr2:12388291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:12388695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B95,C14
`Chr2:12388757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:12388803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D4
`Chr2:12388859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:12389008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:12389011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr2:12389183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:12389192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr2:12389209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,C48,C71,C85
`Chr2:12389286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795012.1

771 aa

386

771

PB1

PF00564 PB1 300-389 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795012.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	300	389	1.4e-13	51.3	PB1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939029.1
TTGAGGTGATCCTGCCAAAGAATGGGGCCCACAAGGATATTCAACATGAGAATTTTTTTCCTAGGGTTTCAGACTCCCAACTCGAACTTTCCAAAACCCCCCATCTTCTCACTGTCACATTCTTTCTATCAAATCGAATCCCTTCCCCTTCTATTTATCACCTGAGATACGCAAATTCAATCAAGAAGACTCACATCTCTCTTCAAAACAATGCTGGCTTGATTCCTGTAAGTTTTATTTCCAGAATTTTCTGTTCAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011239
ATGGGGAAGTCTGGAGGTAGGAAGAAGAAGACTGGCGCCGCCGCCGCCGCCGTAACCCAGGCACAAAACCAAGTGAGCGGCGGAGAGAATCATTCGCCGCCTGTTGTTAATGGCGGTGTTAATTTTGACTCTTCGGTTTTCTTGAAGAGAGCCCATGAGCTCAAGGAAGAAGGTAACCGAAGGTTTCAGGCTAAGGATTACGTGGGTGCTCTTCTGCAGTATGAAAATGCCCTTAAGCTCACTCCCAAAACTCATCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795012.1
MGKSGGRKKKTGAAAAAVTQAQNQVSGGENHSPPVVNGGVNFDSSVFLKRAHELKEEGNRRFQAKDYVGALLQYENALKLTPKTHPDRAVFHSNRAACLMQMKPIDYDTVISECTLALQVQPNFVRALLRRARAFEAIGRYETAMQDVQSLLVADPNHGDALEIAGRLRMALGPRQEAQQDLQSRPSPAALGASAIRGAPIAGIGPCLPARPVPKKPVPSAAAANAVPSNKSEKLYPVPPIENGSEANNHLPKVALKPAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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