当前解析结果
SmilChr02G000784| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000784 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000784 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000784 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 12884119 - 12885638 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011258 |
|---|---|
| GeneID | 131011258 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011258 |
| 原始查询 | LOC131011258 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011258 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057795026.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.60000 | XP_057795026.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057795026.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795026.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795026.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:12884240 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B140,B54,B68,C18,D2 |
Chr2:12884268 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B83 |
Chr2:12884295 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B111,B133,B60,C67 |
Chr2:12884357 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C54,D10 |
Chr2:12884368 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B34,C51,C74 |
Chr2:12884879 |
TAC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 16 | A14,A9,B3,B30,B31,B50,B58,B7,C10,C37,C40,C64,C66,C76,C86,D1 |
Chr2:12884892 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B5,C71,D9 |
Chr2:12884901 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B85,B9,C33,C85,D2 |
Chr2:12884940 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B126,B9,C44 |
Chr2:12884950 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C82,C86 |
Chr2:12885091 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,A20,C81,D10,D5 |
Chr2:12885126 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,B69,C1,D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。