当前解析结果
SmilChr01G004450| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004450 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004450 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004450 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 62623046 - 62623525 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011261 |
|---|---|
| GeneID | 131011261 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011261 |
| 原始查询 | LOC131011261 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011261 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795035.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795035.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795035.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057795035.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057795035.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:62623160 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B124,B76,C64,C66 |
Chr1:62623168 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B93 |
Chr1:62623197 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B124,B76 |
Chr1:62623197 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B124,B76 |
Chr1:62623289 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C21 |
Chr1:62623291 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A2,B26 |
Chr1:62623296 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A7,C27 |
Chr1:62623350 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B123,B125,B2,B99 |
Chr1:62623359 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,C21 |
Chr1:62623371 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C57 |
Chr1:62623382 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr1:62623399 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 30 | A14,A23,A5,B117,B123,B124,B125,B140,B2,B22,B25,B37,B53,B68,B78,B81,B89,B99,C17,C21,C41,C45,C47,C52,C57,C58,C7,C76,C79,D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。