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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000798`

染色体: Chr02 坐标: 13265564-13268160 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000798`
名称	SmilChr02G000798
描述	uncharacterized SmilChr02G000798
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	13265564 - 13268160 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011270`
GeneID	`131011270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011270`
原始查询	`LOC131011270`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=gene-rpl2-2; species=rice; confidence=low
产物	hit=gene-rpl2-2; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG00560` (rpl2) - identity=57.4; qcov=0.454; evalue=5.06e-10; confidence=low
Rice	`gene-rpl2-2` - identity=61.8; qcov=0.462; evalue=4.67e-13; confidence=low
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	-
Pfam	PF00181 (Ribosomal_L2_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057795037.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795037.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795037.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795037.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795037.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:13266027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B137,B35,B70,D2
`Chr2:13266031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B63,C19,C32
`Chr2:13266034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B30,B95,C11,C69
`Chr2:13266035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B66,B82,D5
`Chr2:13266056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr2:13266076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C4
`Chr2:13266188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr2:13266190`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A21,B18,B79,B8
`Chr2:13266190`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A21,B18,B79,B8
`Chr2:13266198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C38,C45,D2
`Chr2:13266220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr2:13266224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B99,C48,C83,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795037.1

119 aa

119

Ribosomal_L2_N

PF00181 Ribosomal_L2_N 65-99 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795037.1`	Pfam	`PF00181`	Ribosomal_L2_N	Domain	65	99	2.8e-07	31.2	Ribosomal Proteins L2, RNA binding N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096831.1
GCTCTCTATTCTGTTTTATCTAAATTCTACCTTTTACTCAAAAAAAAAAAAACTCACGCTTCTCAATTCTCACAGGCATCAATCCCTAATTTGGTATTTTCTCGGCATAGCTTGATCAATGGCTCAAATCTCTCTCTCTCCATATCAATGCAAACGCCCTAATTTGGTATCTGACGCCTTACCATAGGAGCCTTCATGGTATGCCAGCTCTTCTCTGACGCCCTACCATATATGCGCCTCTCTTCCCCTCCCAAATCTAG...

XR_009096830.1
CTCTCTATTCTGTTTTATCTAAATTCTACCTTTTACTCAAAAAAAAAAAAACTCACGCTTCTCAATTCTCACAGGCATCAATCCCTAATTTGGTATTTTCTCGGCATAGCTTGATCAATGGCTCAAATCTCTCTCTCTCCATATCAATGCAAACGCCCTAATTTGGTATCTGACGCCTTACCATAGGAGCCTTCATGGTATGCCAGCTCTTCTCTGACGCCCTACCATATATGCGCCTCTCTTCCCCTCCCAAATCTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011270
ATGTCCGCCGCCGCGAGAACAGTCTTCCGTTCCGCCTCTACATCCGCTCGCAGTGCCACGGCGAGACTATCCACCTCCATTTTCAGGTCTCCTGTAGAGACGAGCAGTTTTAGCGATGCTTCGATTTCGCCACACCGCAGTCAATTCGGAAATGTAGATGGAAGAAATTTCTCAACGAAGACGAGGAGATTTCGATTTCAGCGCAGAATCGATCTGAAACGAAGCACTTCAGCCACTGGAATCGTGGAAAGGATAGAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795037.1
MSAAARTVFRSASTSARSATARLSTSIFRSPVETSSFSDASISPHRSQFGNVDGRNFSTKTRRFRFQRRIDLKRSTSATGIVERIEYDPNRTSRIALKHVWFRSRIAVKYVREMLVCQE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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