当前解析结果
SmilChr01G004470| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004470 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004470 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004470 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 62792722 - 62794168 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011288 |
|---|---|
| GeneID | 131011288 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011288 |
| 原始查询 | LOC131011288 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=33.2; qcov=0.464; evalue=4.03e-42; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011288 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795059.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057795059.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795059.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057795059.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057795059.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:62792799 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:62792844 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C78 |
Chr1:62792906 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B106 |
Chr1:62792943 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr1:62792993 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A7,B20 |
Chr1:62793001 |
A |
ATT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 28 | A11,A16,A18,A22,B105,B108,B131,B133,B138,B2,B22,B24,B29,B41,B44,B46,B50,B75,C12,C14,C2,C23,C26,C30,C33,C59,C82,D7 |
Chr1:62793005 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C39,C5 |
Chr1:62793094 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,C39,C5 |
Chr1:62793098 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C39,C5 |
Chr1:62793120 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C79,C81 |
Chr1:62793138 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B5 |
Chr1:62793140 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A20,B100,B102,B137,C37 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。