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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000878`

染色体: Chr02 坐标: 15104295-15116048 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000878`
名称	SmilChr02G000878
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP62-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	15104295 - 15116048 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011329`
GeneID	`131011329`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011329`
原始查询	`LOC131011329`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP62-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP62-like
Arabidopsis	`AT3G25230` (ROF1) rotamase FKBP 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822117] identity=74.1; qcov=0.835; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0525600` (OsFKBP62a) - identity=69.5; qcov=0.913; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0061077 (GO:0061077)
KEGG	-
Pfam	PF00254 (FKBP_C); PF00515 (TPR_1); PF13181 (TPR_8); PF14559 (TPR_19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011329

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057795094.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057795094.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795094.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795094.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795094.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:15104515`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A21
`Chr2:15104515`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A21
`Chr2:15106340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:15106573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B41,B61,B73,B81
`Chr2:15106759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr2:15111041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B93,C5,D11
`Chr2:15111277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr2:15111375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,A24
`Chr2:15111775`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B135
`Chr2:15111775`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B135
`Chr2:15115555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr2:15115612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795094.1

629 aa

314

629

FKBP_C

TPR_19

TPR_1

TPR_8

PF00254 FKBP_C 59-149 aa PF00254 FKBP_C 174-266 aa PF00254 FKBP_C 292-386 aa PF14559 TPR_19 466-526 aa PF00515 TPR_1 489-522 aa PF13181 TPR_8 490-522 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795094.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	59	149	1.7e-81	269.4	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
`XP_057795094.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	174	266	1.7e-81	269.4	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
`XP_057795094.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	292	386	1.7e-81	269.4	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
`XP_057795094.1`	Pfam	`PF14559`	TPR_19	Repeat	466	526	1.2e-06	29.5	Tetratricopeptide repeat
`XP_057795094.1`	Pfam	`PF00515`	TPR_1	Repeat	489	522	5.7e-12	45.6	Tetratricopeptide repeat
`XP_057795094.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	490	522	1.4e-07	31.8	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939111.1
AAAGAATGTGCGTGTCAATTTCCCCGTATAAATAACACATCATTTACAGTTGGGTGATTGTTAACAAGGATCACCCGACCCATGTACGAGACAACCTCCGCATAGAACTCTCTAGAAACACTCTCCATTGACATATCTCTTACTCTCTCTCTTGATGCTGCTCTAGACCCCTCCATCTCTCTCCCTATAAACATCATCGTCGCCATTTCCTCGCAGAAGAAAAATATCAAAGCTCTAGTCTCCTGTGCACCAAAACAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011329
ATGGATTTCGAAATGGATGATGATTTCGAGTTTCCAGCTGCTGGAAGCAACGAAATGGATGCAGGAAACGATGTTGACCTTCCAGAGGTAAACCCGATCATGAAAGTGGGAGAAGAGAGAGAAATCGGGAAGAATGGGCTGAAGAAGAAGCTCCTCAAAGACGGCGAGAGCTGGCAGAATCCTAATTCGGGCGATGAAGTCGAAGTTCATTATGTGGGTACTTTGCTGGATGGGACTATGTTTGATTCCAGCGTCGACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795094.1
MDFEMDDDFEFPAAGSNEMDAGNDVDLPEVNPIMKVGEEREIGKNGLKKKLLKDGESWQNPNSGDEVEVHYVGTLLDGTMFDSSVDRGIPFIFKLGEGQVIKGWDEGIKTMKKGEKALFTIPPELAYGESGSPPTIPPNATLQFEVELLSWTSVKDICKDGGIFKKVLVEGQGWQNPNDLDEVYVKYEAWLEDGTIVSKEDGVEYTVKDGYFCSALSKAVKTMKKGEKALLTVKPQYGFGEKGKPVSGDEGNVPPNASLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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