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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000922`

染色体: Chr02 坐标: 16012908-16020630 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000922`
名称	SmilChr02G000922
描述	probable galactinol--sucrose galactosyltransferase 2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	16012908 - 16020630 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011361`
GeneID	`131011361`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011361`
原始查询	`LOC131011361`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable galactinol--sucrose galactosyltransferase 2
产物	probable galactinol--sucrose galactosyltransferase 2
Arabidopsis	`AT3G57520` (SIP2) seed imbibition 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824919] identity=47.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0481100` - identity=55; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05691 (Raffinose_syn)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011361

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795141.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057795142.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057795142.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057795141.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057795142.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:16013231`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C85
`Chr2:16013231`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C85
`Chr2:16013242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C28,C36,C72
`Chr2:16013303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:16013357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B32,C45
`Chr2:16013371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B32,C45
`Chr2:16013627`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B135
`Chr2:16013627`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B135
`Chr2:16013776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B32,C45
`Chr2:16013870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C74
`Chr2:16013877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:16014441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795141.1

792 aa

396

792

Raffinose_syn

PF05691 Raffinose_syn 61-777 aa

XP_057795142.1

707 aa

354

707

Raffinose_syn

PF05691 Raffinose_syn 23-692 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795141.1`	Pfam	`PF05691`	Raffinose_syn	Family	61	777	1.1e-251	837.6	Raffinose synthase or seed imbibition protein Sip1
`XP_057795142.1`	Pfam	`PF05691`	Raffinose_syn	Family	23	692	1.5e-242	807.4	Raffinose synthase or seed imbibition protein Sip1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939158.1
CACCCAACCAAAATTCAGACATGAAGAGCGAGAAAGAAACAAAGAAAGAAAAATATCAAGTGGTCCGAAGCGTGGTGGTCCGCTCCAATTGTCGCCAGTATTAGGCGCTTAAAGAGAGAATTATAGATTCGTCCCATCTTCTTTACCTCTCCGTCTACTTTGTGGTCCACCGGATTTACACACTGCATATATATATATATTTATATGTTCATGTAATGCTTTATCGTCACGCACAATCGCCTATCCATGACCACCGCGGT...

XM_057939159.1
CCCAACCAAAATTCAGACATGAAGAGCGAGAAAGAAACAAAGAAAGAAAAATATCAAGTGGTCCGAAGCGTGGTGGTCCGCTCCAATTGTCGCCAGTATTAGGCGCTTAAAGAGAGAATTATAGATTCGTCCCATCTTCTTTACCTCTCCGTCTACTTTGTGGTCCACCGGATTTACACACTGCATATATATATATATTTATATGTTCATGTAATGCTTTATCGTCACGCACAATCGCCTATCCATGACCACCGCGGTGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011361
ATGACCACCGCGGTGTCTTCCACTTCTCTGAGGACTCTGCGGTTCAAATTCAACAATCTGTCTCCATTTTCACCAACCAACGGCAACAAGGTTTTGCAAAATGGCTTTTTGCGTCTGCGCAGAAGTGGTTGCGGCGGCAGGTGCTCTATGTTCGTCAAGACGGCCCCCGTTCTCAAAGATGGAGTCTTGAGCTTCAACGGTAAGAACACGCTTTTGGGCGTGCCGGAGAATGTTGTGGTGACGCCGTGCTCCGATTCAGC...

LOC131011361
ATGTGTTCAAGCTGGGAGTTATTCAATATTACCAACATTGTCAAATGGTGTGATGTATGTGCTGAATGCAGAGGAGCGAGATTTCTGTCGCTGTTTAGGTTCAAGATATGGTGGATGATACCGCGAGTGGGGAGTTCAGCGAAGGACATTCCAGTTGAAACGCAGATGTTGCTTCTGGAGGCAAGGGTAGAGCCAAATTCTGGAGAACCTCATGGAAATACAGCTTATGTGCTGTTTCTGCCTATATTAGATGGAGAATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795141.1
MTTAVSSTSLRTLRFKFNNLSPFSPTNGNKVLQNGFLRLRRSGCGGRCSMFVKTAPVLKDGVLSFNGKNTLLGVPENVVVTPCSDSAAFLGAVSSQSNSRHVFKLGVIQGARFLSLFRFKIWWMIPRVGSSAKDIPVETQMLLLEARVEPNSGEPHGNTAYVLFLPILDGEFRSSLQGNLANELEVCVETGDSNKIGPGSSRAVLVNYGGNPFELIKESMKILQKYNGTFALRETKQMPGMLDWFGWCTWDAFYQDVNPQ...

XP_057795142.1
MCSSWELFNITNIVKWCDVCAECRGARFLSLFRFKIWWMIPRVGSSAKDIPVETQMLLLEARVEPNSGEPHGNTAYVLFLPILDGEFRSSLQGNLANELEVCVETGDSNKIGPGSSRAVLVNYGGNPFELIKESMKILQKYNGTFALRETKQMPGMLDWFGWCTWDAFYQDVNPQGIRDGLKSLSEGGTPARFLIIDDGWQDTANEFQKEGEPFREGSQFGGRLMSIRENEKFRKAANDDSSGTPHSLKDFVSDIKGTYG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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