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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000935`

染色体: Chr02 坐标: 16332750-16336805 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000935`
名称	SmilChr02G000935
描述	phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	16332750 - 16336805 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011372`
GeneID	`131011372`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011372`
原始查询	`LOC131011372`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH2-like
产物	phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH2-like
Arabidopsis	`AT5G47730` (AT5G47730) Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834824] identity=68.6; qcov=0.979; evalue=3.78e-167; confidence=high
Rice	`Os02g0200000` - identity=64; qcov=0.979; evalue=5.09e-161; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO); PF03765 (CRAL_TRIO_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011372

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795159.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795159.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795159.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795159.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795159.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:16334318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:16335106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:16335430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B56,B59,B96,C37
`Chr2:16335486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C34
`Chr2:16336242`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C87
`Chr2:16336313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C32,C68
`Chr2:16336322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr2:16336485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B140,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795159.1

329 aa

164

329

CRAL_TRIO_N

CRAL_TRIO

PF03765 CRAL_TRIO_N 8-59 aa PF00650 CRAL_TRIO 89-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795159.1`	Pfam	`PF03765`	CRAL_TRIO_N	Domain	8	59	5.8e-11	43.1	CRAL/TRIO, N-terminal domain
`XP_057795159.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	89	241	2.5e-18	67.1	CRAL/TRIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939176.1
GAGCTGCTCGCTTCTCCACCGGTAGATTAAATTGCCAGATTCTTTTCAAAATACACAATTATTTTATCTTTTGATCAAACTGTGTAATATACTAATAATTTTGTTGCTGTCCTTAGCCGACCAGATGTGTCATTTCAACCGATTAATGAATGAAACCAAAAAAGAGAGAATAAAATACACTAGAATCAAATTTCTATAAATCATGTATAGTGTTAGGTACTAATTCTTTTATTCATTGCCACTAACTGATCATCTTCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011372
ATGGCTCTGGTTACTCAAGAAGCCATCAACCAATTTGAAGCATTAATGGAGGAAGTGGACGAACCACTCAAAAAAACTTTCCAGAATGTACATCAAGGATATCCTCATGAAACGTTTACTCGTTTTCTGAAGGCGCGAGAAGGGAATGCTCAAAAGGCTCATAAGATGTTGGTTGACTGCTTGGAGTGGAGAGTTCAAAATGACATTGATAATATGCTAGCGAAACCAATTGTTCCCGAGGAACTTTACAGAGGGATACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795159.1
MALVTQEAINQFEALMEEVDEPLKKTFQNVHQGYPHETFTRFLKAREGNAQKAHKMLVDCLEWRVQNDIDNMLAKPIVPEELYRGIRDSQLVGLSGYSNEGLPVFAVGVGLSTFDRASVHYYVQSHIQINEYRDRVILPAATKKYGKHISKCVKILDMTGLKLSALNQIKLLTIISSIDDLNYPEKTQTYYIVNAPYVFSACWKVVKPLLQERTRSKIDVLSSCGQDDLLKIMDYSSLPHFCRKRSSDSSKYSESSSGNC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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