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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000944`

染色体: Chr02 坐标: 16460055-16463592 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000944`
名称	SmilChr02G000944
描述	nucleolar protein 56-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	16460055 - 16463592 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011380`
GeneID	`131011380`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011380`
原始查询	`LOC131011380`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleolar protein 56-like
产物	nucleolar protein 56-like
Arabidopsis	`AT1G56110` (NOP56) NOP56-like pre RNA processing ribonucleoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842063] identity=81.2; qcov=0.858; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0352300` - identity=81.7; qcov=0.839; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0030515 (snoRNA binding); GO:0031428 (box C/D methylation guide snoRNP complex); GO:0032040 (small-subunit processome)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01798 (Nop); PF08156 (NOP5NT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011380

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795162.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057795162.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057795162.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795162.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795162.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:16460295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B86,B89,C75
`Chr2:16460352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B4,C27,D3
`Chr2:16461178`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C43
`Chr2:16461178`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C43
`Chr2:16461206`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B110,B112,B38,B5,C17,C2,C32,C65,C68
`Chr2:16461312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:16461454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,D11
`Chr2:16461514`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B14,D11
`Chr2:16461514`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B14,D11
`Chr2:16461554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B27,B28,C45
`Chr2:16461858`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B1,B115,B127,B131,B20,B44,C28,C63
`Chr2:16461875`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B41,B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795162.1

514 aa

257

514

NOP5NT

Nop

PF08156 NOP5NT 4-69 aa PF01798 Nop 177-409 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795162.1`	Pfam	`PF08156`	NOP5NT	Domain	4	69	9.5e-22	77.9	NOP5NT (NUC127) domain
`XP_057795162.1`	Pfam	`PF01798`	Nop	Family	177	409	3.6e-88	295.6	snoRNA binding domain, fibrillarin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939179.1
TTTTTTGAAAGGAATGTGGAGTAATAAATAATGAAAGAGTGAGGCCCGGCCCGGTCCCATGTCACATTCTGTCTTCTAAAACGAAAAACCCTAAACCTAAACTCCACACATAAACCTCTCCGCCCCATTCCTCTTGTCTCACACACACAGAGAGGCGAAAAAATCCCTTAACCTAAAATTCACAGCGATGACGCTGTACGTGCTATACGAGTCCGCGTCGGGATACGGTCTCTTCTCAGCCGACGGAATTGATGAAATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011380
ATGACGCTGTACGTGCTATACGAGTCCGCGTCGGGATACGGTCTCTTCTCAGCCGACGGAATTGATGAAATCGGCCAGAACACGGAGGCCGTCCGGAGCTCCGTCGTCGACCTGAACCGCTTCGGTAAGGTGGTCAAGCTCGCCGCCTTTACTCCGTATGACTCCGCGCTTGATGCGCTCAACCAGTGCAACGCCATCTCTGAAGGTCAAATGACTGATGAGCTGAGGAACTTTTTGGAGCTAACTTTACCCAAGGTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795162.1
MTLYVLYESASGYGLFSADGIDEIGQNTEAVRSSVVDLNRFGKVVKLAAFTPYDSALDALNQCNAISEGQMTDELRNFLELTLPKVKEGKKPKFSLGVGEPKLGSHIFEVTKIPCQSNEFVLELIRGIRLHFVRFIENLKPGDLEKAQLGLGHSYSRAKVKFNVNRVDNMVIQAIFLLDTLDKDVNSFSMRVREWYSWHFPELVKIVNDNYLYAKVAKYIEDKAQLSEDKLSGLTDIVGDEDKAKEIIEAAKASMGQDLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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