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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000949`

染色体: Chr02 坐标: 16501800-16512624 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000949`
名称	SmilChr02G000949
描述	uncharacterized SmilChr02G000949
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	16501800 - 16512624 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011386`
GeneID	`131011386`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011386`
原始查询	`LOC131011386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G28950` (AT5G28950) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833021] identity=45.9; qcov=0.609; evalue=2.71e-23; confidence=medium
Rice	`Os11g0577650` - identity=59; qcov=0.652; evalue=7.99e-40; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011386

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057795177.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057795178.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057795176.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057795176.1`
5	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057795176.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:16502250`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A14,A21,B100,B119,B42,B43,B76,C18,C38,C43,C45,C47,C48,C54,C8
`Chr2:16502310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A21,B119,B42,B76,C18,C38,C43,C45,C47,C54,C8
`Chr2:16507372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C52
`Chr2:16507388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B124,B13,B134,C56,C63,C68
`Chr2:16507423`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B89
`Chr2:16507423`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B89
`Chr2:16507427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C48
`Chr2:16507427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:16507437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr2:16507444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:16507494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:16507514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B56,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795178.1

161 aa

161

DDE_Tnp_4

PF13359 DDE_Tnp_4 74-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795178.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	74	131	6.2e-08	33.1	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096881.1
TCATTATTTTATTCAATAAAAAAAATTGAGAGTTTTATTCTCTCTTTGGCTTGTCTTTGAATTCTTGCAAATTCAATGTGAGATTCAATAATGACTTATCAAATGGAATCACCAACCCCATTTGTAGCTTCTGTCACGAATATGGACTCAGTGGAGCTTGAAGACAAGCCTGGTTTCGATGCTATGACTGATTTGGGGAAGAAAGGGGATTTGGAGGAGAAAGGCTTGGTGGAGAATAAACAAACACATGGCTAAAGTGG...

XR_009096882.1
TCATTATTTTATTCAATAAAAAAAATTGAGAGTTTTATTCTCTCTTTGGCTTGTCTTTGAATTCTTGCAAATTCAATGTGAGATTCAATAATGACTTATCAAATGGAATCACCAACCCCATTTGTAGCTTCTGTCACGAATATGGACTCAGTGGAGCTTGAAGACAAGCCTGGTTTCGATGCTATGACTGATTTGGGGAAGAAAGGGGATTTGGAGGAGAAAGGCTTGGTGGAGAATAAACAAACACATGGCTAAAGTGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131011386
ATGGGAATTAACAATTTCTTCATCCTTATTTCTCTCTCTTCCCTATTCCTATCTTCTATTTCACGATCTGCACTTCCAATTCAATATACATATATCTGGGCCCACTACAATTGGTATCTAGAGTCAGTTTTTGCATCTTTAGCAAATTCTGGGCGAGTCATGGCGGAAGCAACTCGATTTAAGGACCTGCAAGAAGCAAAAAAGAAATTAGATCAAATTCTACAAACTGAAACCATGAAAAGGGTGGCAGCTGAGGAGAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057795176.1
MGINNFFILISLSSLFLSSISRSALPIQYTYIWAHYNWYLESVFASLANSGRVMAEATRFKDLQEAKKKLDQILQTETMKRVAAEEKIHEQMSAIDQKVEHKIRGIDHKCDHLAKLMADIQLQLMNVGKDVGKSDSSILGKDPLHLQSVLHVGVQKYLKNSEEFVKSQLNRPVIFKTSFEASNVLKLYSAQKYYFFVFERAFRGRLFRLNRSSVEEVMAVFPKLPELNFLRKI

XP_057795177.1
MGINNFFILISLSSLFLSSISRSALPIQYTYIWAHYNWYLESVFASLANSGRVMAEATRFKDLQEAKKKLDQILQTETMKRVAAEEKIHEQMSAIDQKVEHKIRGIDHKCDHLAKLMADIQLQLMNVGKDVGKSDSSILGKDPLHLQSAISAAEKAFVSYPKTRIASSSEVSSNNPICSCRLTMIVFCC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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