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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000978`

染色体: Chr02 坐标: 17151028-17160868 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000978`
名称	SmilChr02G000978
描述	uncharacterized SmilChr02G000978
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	17151028 - 17160868 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011409`
GeneID	`131011409`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011409`
原始查询	`LOC131011409`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835721]; symbol=AT5G56220; hit=AT5G56220; species=arabidopsis; confidence=high
产物	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835721]; symbol=AT5G56220; hit=AT5G56220; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G56220` (AT5G56220) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835721] identity=65.4; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0499100` - identity=59.5; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000725 (recombinational repair); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF25895 (WHD_plant_disease)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011409

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057795203.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057795203.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057795203.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795203.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795203.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:17157969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:17158091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:17158190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B67,B77
`Chr2:17158264`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A2,A5,B106,B110,B124,B22,B3,B51,B64,B84,C25,C30,C31,C48,C71
`Chr2:17158268`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A2,A5,B106,B110,B124,B22,B3,B51,B64,B84,C25,C30,C31,C48,C71
`Chr2:17158492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr2:17158523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B6
`Chr2:17158597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:17158667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:17158746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:17158764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:17158983`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A10,B29,B31,B35,B41,B61,B65,B67,B69,B74,B89,C40,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795203.1

912 aa

456

912

NB-ARC

WHD_plant_disease

PF00931 NB-ARC 373-516 aa PF25895 WHD_plant_disease 618-732 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795203.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	373	516	4.8e-08	33.5	NB-ARC domain
`XP_057795203.1`	Pfam	`PF25895`	WHD_plant_disease	Domain	618	732	6.2e-41	139.8	Winged Helix Domain in plant disease resistance proteins

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939220.1
GCACATTTACTACACTCTGCAGCTCCTTTTAAAGCATTTATTTCTATATTTTATGTTCAAAACCTCATGGATCCAACCCACACTTTAGATTCTCCCATATGTACAGCTTGTTCATGAGAGAGAGAGAAATACAGAAGGGGTCTCACCCTTTTCCTTCCTTTCTTGAGCTCTCAAAGTCAAAAACTAAGCAGTAACAAAAGCTGAGGCGTCTGTTAATTCTGACTCTGCGACGGAGGCCCACAGTTGAAGAAGAAGATGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011409
ATGGATGCTGAGCAAATCTCCACCGTCGATCTCACCATCAAGATTGCGGCGGCGGACGCAACAGAAAATTCATCTCCGTACACCTCGCCGCTGGTGTCCCCACCCTCGTCGGCATTCGTGTCGGCGCTGCAGTCCCCTTACATCTCCCCGAGGGCCAACTCCGACGACGTCCCCACTCCGGCCACCACGCTCACCCACCCCTCCCCGCCGGTGTCGTACAGCGGCTCCCAGTCTGACGACGTCCCGAGCACCTCCTACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795203.1
MDAEQISTVDLTIKIAAADATENSSPYTSPLVSPPSSAFVSALQSPYISPRANSDDVPTPATTLTHPSPPVSYSGSQSDDVPSTSYTPPPEKLKIVTCAAEAAPRISFSFPIPRISFAKGSASPAGGGGGLAKLRSCDVYIGFHGQNPNLVRFCKWLKSELEVQGIASFTADRAKYADSQSHEIADRVICSVAFGVVIITDYTLLNHLSLEEIRFFAQKKNLIPLFFDTDAKEIASLFNPHADGNKECKEALDGLMRCHD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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