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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000981`

染色体: Chr02 坐标: 17263794-17268668 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000981`
名称	SmilChr02G000981
描述	F-box protein At-B
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	17263794 - 17268668 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011411`
GeneID	`131011411`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011411`
原始查询	`LOC131011411`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At-B
产物	F-box protein At-B
Arabidopsis	`AT1G55590` (AT1G55590) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842008] identity=50.5; qcov=0.942; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0135400` (OsFbox128) - identity=33.4; qcov=0.945; evalue=2.52e-79; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF25372 (LRR_FBXL15)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011411

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795205.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795205.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795205.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795205.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795205.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:17264834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B125,B135,B28,C36
`Chr2:17264842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B77,C13,C64,C66
`Chr2:17264925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:17264935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:17264996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B135,B28,C36
`Chr2:17265232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B64
`Chr2:17265240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B64
`Chr2:17265309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B35,B69
`Chr2:17267436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:17267574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:17267586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:17267588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B15,C32,C68,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795205.1

637 aa

318

637

F-box

LRR_FBXL15

PF00646 F-box 45-74 aa PF25372 LRR_FBXL15 82-631 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795205.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	45	74	0.00024	21.6	F-box domain
`XP_057795205.1`	Pfam	`PF25372`	LRR_FBXL15	Repeat	82	631	8.3e-167	556.6	F-box/LRR-repeat protein 15, leucine rich repeat domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939222.1
ATCAATCTCCACCATCTACACTAGATTATTTATCCCAAGGAGCCGAATGTTTCGGAAGATCATTGGCGACATGAAAAATTGCAGTAAAAGACCCCGAGAGAAGACCGCCGCCAAGGCGGCCGAAGACATTGGTGGCGCACCGCCGCCGAGAGACGGCTTTCTTCTACCAAATACCATAGTTCTCAGCGAAATCTTAACGAGATTAGAACTGGATGCACTTTGCACTGTGGCTTGCGTGTCTCGAACCCTTCGCTCCCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011411
ATGTTTCGGAAGATCATTGGCGACATGAAAAATTGCAGTAAAAGACCCCGAGAGAAGACCGCCGCCAAGGCGGCCGAAGACATTGGTGGCGCACCGCCGCCGAGAGACGGCTTTCTTCTACCAAATACCATAGTTCTCAGCGAAATCTTAACGAGATTAGAACTGGATGCACTTTGCACTGTGGCTTGCGTGTCTCGAACCCTTCGCTCCCTGGTCTCTCAATCTCTTATGACTCTTCCCTCTCTCGATCTCTCTGCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795205.1
MFRKIIGDMKNCSKRPREKTAAKAAEDIGGAPPPRDGFLLPNTIVLSEILTRLELDALCTVACVSRTLRSLVSQSLMTLPSLDLSAFSPNGELVSCIAPRLGAVKSVTIDCLKVYECSIVSILGPHLLELNLLKCPWLSYHVLPSIGEKCPNLRNLVLELAGKNAPEIFRKSFVKMLQNLLYLEHLSIKVRGTESDAYSLTYVDLFLPKTLKSLKLQLVNERDAGLLIEKLGDDRESSRKMVNPSTSITSYQGFSGFTLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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