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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000354`

染色体: Chr01 坐标: 7338112-7339145 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000354`
名称	SmilChr01G000354
描述	uncharacterized SmilChr01G000354
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	7338112 - 7339145 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011420`
GeneID	`131011420`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011420`
原始查询	`LOC131011420`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0271500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os06g0271500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0271500` - identity=31.2; qcov=0.279; evalue=2.41e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011420

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795235.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795235.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795235.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795235.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795235.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:7338250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C83
`Chr1:7338255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B26,C65
`Chr1:7338255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C65
`Chr1:7338275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr1:7338289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C39
`Chr1:7338298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B101,B4,B98,D2
`Chr1:7338309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A3,B106,B113,B124,B17,B22,B23,B24,B33,B44,B46,B56,B62,B64,B73,B80,B84,B96,C20,C29,C61,C62,C70,C71,C76,C82,C85,C87,D3
`Chr1:7338311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C74
`Chr1:7338319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:7338333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B90
`Chr1:7338334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,D10
`Chr1:7338336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A25,B112,B122,B137,B14,B97,C17,C28,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795235.1

276 aa

138

276

Transpos_assoc

Transposase_24

PF13963 Transpos_assoc 5-84 aa PF03004 Transposase_24 122-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795235.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	84	8.6e-22	77.8	Transposase-associated domain
`XP_057795235.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	122	193	2.5e-10	41.3	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939252.1
ATGAGTGAAAATCGTGAGTGGATGTATCGGCGTTTTCTACCTGATGGAGCTTTGAATCCCGATTTTCAAAGAGGTCTTCAAGGTTTCATTGATTACGCTAACAGTAGACGTGATTTAATGGATGGTGAAAAAATTAGGTGTCCGTGTAGGAAATGCGATAATATACGTTTCCATACTAAAAACAATGTTCAGTATCACATTGCAAAGAACGGATTTGTGCGGGATTACCATATTTGGAGGTTTCATGGTGAAATTGAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011420
ATGAGTGAAAATCGTGAGTGGATGTATCGGCGTTTTCTACCTGATGGAGCTTTGAATCCCGATTTTCAAAGAGGTCTTCAAGGTTTCATTGATTACGCTAACAGTAGACGTGATTTAATGGATGGTGAAAAAATTAGGTGTCCGTGTAGGAAATGCGATAATATACGTTTCCATACTAAAAACAATGTTCAGTATCACATTGCAAAGAACGGATTTGTGCGGGATTACCATATTTGGAGGTTTCATGGTGAAATTGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795235.1
MSENREWMYRRFLPDGALNPDFQRGLQGFIDYANSRRDLMDGEKIRCPCRKCDNIRFHTKNNVQYHIAKNGFVRDYHIWRFHGEIEMPTTEYHNFEEEEANEDNYQNMGKRKGVEPTECLYDAYEILHKNKDGTYIDERSRRIGEKVQDIVASQSQAVDDDSDPPEIDMNKVYVEAVGGLDKKKRMFGVGGLAASLRSSEQSSGTSQFQGPLVDPQQLMDVEQQLQDALVEIARQKEEMRQKDEQTDARFQAQQRMFEEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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