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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001002`

染色体: Chr02 坐标: 17648870-17652538 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001002`
名称	SmilChr02G001002
描述	cellulose synthase-like protein E1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	17648870 - 17652538 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011431`
GeneID	`131011431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011431`
原始查询	`LOC131011431`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cellulose synthase-like protein E1
产物	cellulose synthase-like protein E1
Arabidopsis	`AT1G55850` (CSLE1) cellulose synthase like E1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842035] identity=56.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0725300` (OsCslE2) - identity=54; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009833 (plant-type primary cell wall biogenesis); GO:0016760 (cellulose synthase (UDP-forming) activity); GO:0030244 (cellulose biosynthetic process); GO:0051753 (mannan synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03552 (Cellulose_synt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057795219.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057795219.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057795219.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795219.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795219.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:17649089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B130,C61
`Chr2:17649201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr2:17649601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B54,C15
`Chr2:17649691`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	C46,D4
`Chr2:17649691`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C46,D4
`Chr2:17649877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr2:17650007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr2:17650027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:17650066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr2:17650328`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	53	A1,A11,A16,A21,A24,A7,B111,B113,B123,B127,B128,B129,B130,B134,B14,B27,B28,B31,B32,B38,B39,B4,B44,B49,B5,B50,B62,B72,B77,B82,B85,C11,C14,C18,C25,C27,C29,C3,C31,C33,C42,C44,C49,C58,C67,C69,C7,C73,C79,C80,C81,C83,C85
`Chr2:17650965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C51
`Chr2:17651002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B35,B72,C43,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795219.1

727 aa

364

727

Cellulose_synt

PF03552 Cellulose_synt 94-384 aa PF03552 Cellulose_synt 403-724 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795219.1`	Pfam	`PF03552`	Cellulose_synt	Domain	94	384	5.9e-137	458.9	Cellulose synthase
`XP_057795219.1`	Pfam	`PF03552`	Cellulose_synt	Domain	403	724	5.9e-137	458.9	Cellulose synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939236.1
TTAAAATCCAAAACGCCCACCATGTGTTGTGTATATATATATATATAGACAAGAGATTGATTAACTACAAGTCATCAGTTGAAAACCTCATCTCTGAGTAATAAATGATGGCTGAAAACTCACTTTTCGAAACCAAGAAAGTCAAGGGCGGTTCCGTCTACAAGCTCTTTGCTACTTTCATATTCGTGGGAATCATTCTGATTTGGGTTTACAGAGCAACTCACGTCATCGAAAATGGGAGGCTTGTTTGGATGGGAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011431
ATGATGGCTGAAAACTCACTTTTCGAAACCAAGAAAGTCAAGGGCGGTTCCGTCTACAAGCTCTTTGCTACTTTCATATTCGTGGGAATCATTCTGATTTGGGTTTACAGAGCAACTCACGTCATCGAAAATGGGAGGCTTGTTTGGATGGGAATGCTTGCAGCAGAATTATGGTTCGGGTTTTACTGGATCCTCACTCAGTCCCATCGCTGGAATCGCGTTCATCGCCGCACCTTCAAAGACAGGCTCTCGCAGAGGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795219.1
MMAENSLFETKKVKGGSVYKLFATFIFVGIILIWVYRATHVIENGRLVWMGMLAAELWFGFYWILTQSHRWNRVHRRTFKDRLSQRYENDLGGVDIFVCTADPKIEPPMLVINTVLSVMAYDYPPEKLAVYLSDDAASDLTFYALLEASTFAKHWLPYCKKFKVEPRSPQPYFSSESAHLEPHQAQRFASLKKLYEEMENRIELAKKLGTVAKSALIEHRGFSSWDSYRSQTDHDAMLHILIDRDGEATDIEGCRLPTLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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