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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001015`

染色体: Chr02 坐标: 17888415-17890250 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001015`
名称	SmilChr02G001015
描述	probable alpha-mannosidase At5g66150
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	17888415 - 17890250 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011439`
GeneID	`131011439`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011439`
原始查询	`LOC131011439`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable alpha-mannosidase At5g66150
产物	probable alpha-mannosidase At5g66150
Arabidopsis	`AT5G66150` (AT5G66150) Glycosyl hydrolase family 38 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836747] identity=60.3; qcov=0.951; evalue=2.93e-41; confidence=medium
Rice	`Os10g0140200` - identity=58.3; qcov=1.04; evalue=6.07e-41; confidence=medium
GO	GO:0004559 (alpha-mannosidase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF21260 (Laman-like_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011439

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057795221.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795221.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795221.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795221.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795221.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:17888602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr2:17888995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr2:17889006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B63,B83,C27
`Chr2:17889012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:17889061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C8
`Chr2:17889064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr2:17889103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:17889270`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	98	A1,A11,A16,A19,A2,A22,A23,A24,A5,A8,B10,B101,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B119,B123,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B135,B140,B20,B25,B26,B28,B29,B3,B4,B42,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B54,B57,B60,B61,B68,B69,B71,B72,B74,B79,B80,B81,B82,B88,B89,B9,B91,B93,B98,B99,C13,C14,C16,C17,C19,C2,C20,C21,C23,C29,C3,C30,C4,C40,C41,C42,C45,C46,C47,C48,C49,C54,C56,C62,C67,C71,C74,C77,C8,C83,C86,C87,C9,D4,D5,D7
`Chr2:17889287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B63,B83,C27
`Chr2:17889289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B104,B113,B117
`Chr2:17889300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795221.1

122 aa

122

Laman-like_dom

PF21260 Laman-like_dom 24-45 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795221.1`	Pfam	`PF21260`	Laman-like_dom	Domain	24	45	2.1e-09	38.2	Lysosomal alpha-mannosidase-like, central domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096927.1
CTGATCATGTACTGTTAGGCTGATGCTGGAGAGTCACCCTCACTTGTTGCTCGAGGATTCAGCACTGTTCAGGCTGCTAGTGGTGGTGACCAACTTGAAATTCAAGTTCCAGTTGAAAAGGTTGGTTTAATAATTGGGAAGGGTGGAGAAACTAAAAACTTGCAGACAAGATCTGGGGAAGTCTTTCTTGTCCCAATTTGTTCTATATTATGTCCTTAAGTTAGGCGACTGGGCTCCTAATGTTATAATGGTGGTTATTC...

XM_057939238.1
AGGTTGGTTTAATAATTGGGAAGGGTGGAGAAACTAAAAACTTGCAGACAAGATCTGGGGAAGTCTTTCTTGTCCCAATTTGTTCTATATTATGTCCTTAAGTTAGGCGACTGGGCTCCTAATGTTATAATGGTGGTTATTCAATCCTTGTTTGATTTGCTGTTTCTCTCTCTCTAACAGTGTCAGTTACTCAACATAAGTTACTGTCCATCAACGGAAGAAGATGTTCCCAAAGGGAAGAGTTTGGTTGTTGTCGCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011439
ATGGATAATGTGACAAGTGAACTGAGAAAGTTCTATCTGAAGGCATATCTTGGGATTTCAGACATCAGAGCTGCCAAATATTGGCTCGTCTTTCCGGCATCTGTGCCACCTTTGGGCTGGAACACTTACTTCATCTCTAAAGGAACTCAAAAAGGAAGGAGACGAAAATTTATGTCTATGATGGATGTTGCACAGAATGAAACTATCAATATTGGACCAGGAAACTTGAAACTGTCAATTTCCACCACATCAGGGCAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795221.1
MDNVTSELRKFYLKAYLGISDIRAAKYWLVFPASVPPLGWNTYFISKGTQKGRRRKFMSMMDVAQNETINIGPGNLKLSISTTSGQLTRIFNSKTGVDIPVQQSYLWYASSPGDATTLEYIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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