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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001068`

染色体: Chr02 坐标: 18992446-18994320 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001068`
名称	SmilChr02G001068
描述	uncharacterized SmilChr02G001068
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	18992446 - 18994320 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011473`
GeneID	`131011473`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011473`
原始查询	`LOC131011473`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=26.2; qcov=0.785; evalue=4.87e-45; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=35.9; qcov=0.982; evalue=5.67e-97; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011473

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795250.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795250.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795250.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795250.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795250.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:18992817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr2:18992837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B41,B90,C42,C82
`Chr2:18992901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B74,C25
`Chr2:18993159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C84
`Chr2:18993245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B106,B19,B96,C22,C63
`Chr2:18993245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B19,B96,C22,C63
`Chr2:18993256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C15,C46,C68
`Chr2:18993355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C27,C41
`Chr2:18993393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B41,B90,B92,C82
`Chr2:18993489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,B81,B83
`Chr2:18993495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B68,C48
`Chr2:18993511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795250.1

511 aa

256

511

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 41-136 aa PF00872 Transposase_mut 59-175 aa PF04434 SWIM 289-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795250.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	41	136	1.2e-16	61.6	MULE transposase domain
`XP_057795250.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	59	175	4e-06	26.7	Transposase, Mutator family
`XP_057795250.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	289	316	4.7e-08	33.1	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939267.1
AGGGCTAAGCTTATGCTCTAGAGACACTGAGAGGATCAGTGACTGGCCACTATGCAAAGCTAAGGAGTTATATATCTGAGCTTATGAGAGTTGACAGAGAAGGGAGATTTGAATTACTGGTAGGTGATGGTACAATATTTAAAGGGTTGTATATAGGTTTTAGTGCTCTGAAAAAGGGATTTGTGGAGGGATGTAGACCCATCATAGGCCTAGATGGTTGTTTCCTGAAGACTCATCTAGGAGGGCAGCTTCTTTGTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011473
ATGAGAGTTGACAGAGAAGGGAGATTTGAATTACTGGTAGGTGATGGTACAATATTTAAAGGGTTGTATATAGGTTTTAGTGCTCTGAAAAAGGGATTTGTGGAGGGATGTAGACCCATCATAGGCCTAGATGGTTGTTTCCTGAAGACTCATCTAGGAGGGCAGCTTCTTTGTGCTATTGGAAAGGATGGAAATAACCAGATGTATCCAATTGCTTGGGCGGTTGTTGAAGTGGAAAATGAGGCATGTTGGGCATGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795250.1
MRVDREGRFELLVGDGTIFKGLYIGFSALKKGFVEGCRPIIGLDGCFLKTHLGGQLLCAIGKDGNNQMYPIAWAVVEVENEACWAWFISMLLEELGVTDGSGYTFISDQQKGLTNAIKDLAPFAEHRNCARHVYMNWKKQFKGVTLKHMFWEGVRSSYKEEWDAAMDKLKAENMMAYENFIERDPSRFCKAFISTACVSDMVDNNVSETFNGYILNARGKHIIHMLEAVRSGLRERQFQKLKHVESVSDVLTPAVRKKVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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