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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001112`

染色体: Chr02 坐标: 20022826-20025851 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001112`
名称	SmilChr02G001112
描述	pre-mRNA-processing protein 40A-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	20022826 - 20025851 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011507`
GeneID	`131011507`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011507`
原始查询	`LOC131011507`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA-processing protein 40A-like
产物	pre-mRNA-processing protein 40A-like
Arabidopsis	`AT1G44910` (PRP40A) pre-mRNA-processing protein 40A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841057] identity=52.1; qcov=0.681; evalue=2.24e-21; confidence=medium
Rice	`Os01g0532200` - identity=41.5; qcov=0.681; evalue=1.48e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25432 (FF_PRPF40A)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011507

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795269.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795269.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795268.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795268.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795268.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:20023066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B44,B59
`Chr2:20023071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:20023941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:20023947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:20024540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B135,B31,B55,C80
`Chr2:20024540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B31,B55,C80
`Chr2:20025150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,D5
`Chr2:20025189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C35
`Chr2:20025191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C80
`Chr2:20025194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C35
`Chr2:20025202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B17,B72,C41,C47
`Chr2:20025214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B71,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795268.1

154 aa

154

FF_PRPF40A

PF25432 FF_PRPF40A 48-91 aa

XP_057795269.1

138 aa

138

FF_PRPF40A

PF25432 FF_PRPF40A 48-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795268.1`	Pfam	`PF25432`	FF_PRPF40A	Domain	48	91	1.1e-12	48.3	PRPF40A-like, FF domain
`XP_057795269.1`	Pfam	`PF25432`	FF_PRPF40A	Domain	48	91	8.1e-13	48.7	PRPF40A-like, FF domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096971.1
TCTCTCTAGTTCGCCTCCCCCCAAATCCGAGTCCGCCGCGCCTTCCCCGAGTCCGCCGCGCCGCGCCCCCCATCTACCGCGCCTTCATCCAGCTCCCCCAGTCCATCGCGCCCTCGGTCTGCCTCCGTCTGCCCCAAAATCAGCGTATAATTCCCCACCCAACCAAACCCTAACACTCTCTTTCTCTCTTGTCCGCCACTCCACTACTCCAGTCTGTCGTGCCCTGGTCTTCTGAGCCTCCGTCTGCTTTCCCCAAGTCT...

XR_009096974.1
TCTCTCTAGTTCGCCTCCCCCCAAATCCGAGTCCGCCGCGCCTTCCCCGAGTCCGCCGCGCCGCGCCCCCCATCTACCGCGCCTTCATCCAGCTCCCCCAGTCCATCGCGCCCTCGGTCTGCCTCCGTCTGCCCCAAAATCAGCGTATAATTCCCCACCCAACCAAACCCTAACACTCTCTTTCTCTCTTGTCCGCCACTCCACTACTCCAGTCTGTCGTGCCCTGGTCTTCTGAGCCTCCGTCTGCTTTCCCCAAGTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011507
ATGAAGAGAAGAAACGGGTCAGAAAGATGGGCTAGGGTTTTCCAGACTCCAGTTTTCGCGCGCCTCCACGATCTGCCGCGCCGCTTCCTTTTCAGACCGCCGTCCGTCTGTCCACTGGCAACTCACGCACACCGCACACACACGATAACAGTTGCTTCAACGTGGACATTTGAAGACTTTAAGTCCTCTTTTGGAGATGACACTGTTTTGTCCTCCATATCTGACATAAATTTGCAGCTAGTATTCAAAGATCTTATTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795268.1
MKRRNGSERWARVFQTPVFARLHDLPRRFLFRPPSVCPLATHAHRTHTITVASTWTFEDFKSSFGDDTVLSSISDINLQLVFKDLIDRAKEKEEKEVKKRKRLAKDFTEKLSTIKELNVLSSWEECKPLIEESSEYRLSLCVGFSPELVVADLS

XP_057795269.1
MKRRNGSERWARVFQTPVFARLHDLPRRFLFRPPSVCPLATHAHRTHTITVASTWTFEDFKSSFGDDTVLSSISDINLQLVFKDLIDRAKEKEEKEVKKRKRLAKDFTEKLSTIKELNVLSSWEECKPLIEESSEYSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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