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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000355`

染色体: Chr01 坐标: 7344787-7352905 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000355`
名称	SmilChr01G000355
描述	DDT domain-containing protein PTM-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	7344787 - 7352905 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011516`
GeneID	`131011516`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011516`
原始查询	`LOC131011516`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DDT domain-containing protein PTM-like
产物	DDT domain-containing protein PTM-like
Arabidopsis	`AT5G22760` (AT5G22760) PHD finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832339] identity=30.6; qcov=0.772; evalue=4.07e-112; confidence=low
Rice	`Os07g0661550` - identity=48.5; qcov=0.179; evalue=4.37e-55; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD); PF02791 (DDT); PF15612 (WHIM1); PF21743 (PTM_DIR17_Tudor); PF24294 (Chromo_PTM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011516

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795298.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795298.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795298.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795298.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795298.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:7345106`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A22
`Chr1:7345106`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A22
`Chr1:7345251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:7349780`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A13,A7,B122,B61,B81,B82,B84,C16,C59
`Chr1:7349863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,C21,C73,C86
`Chr1:7349865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr1:7350186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B3,C24,C46
`Chr1:7350249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B98,C35,C39
`Chr1:7350289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B41,B49,B50,B60
`Chr1:7351302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C5
`Chr1:7351824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B29,B44
`Chr1:7352192`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	76	A10,A13,A15,A20,A21,A7,B106,B109,B112,B115,B119,B120,B122,B126,B127,B129,B130,B134,B14,B140,B3,B32,B35,B36,B46,B48,B51,B59,B61,B63,B64,B66,B70,B74,B75,B76,B78,B8,B81,B82,B83,B84,B87,B89,B9,B95,C1,C10,C15,C16,C19,C22,C23,C24,C27,C28,C32,C33,C35,C40,C44,C46,C52,C54,C56,C59,C65,C68,C71,C73,C81,C87,D1,D10,D3,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795298.1

1148 aa

574

1148

PTM_DIR17_Tudor

DDT

WHIM1

PHD

Chromo_PTM

PF21743 PTM_DIR17_Tudor 5-53 aa PF02791 DDT 328-381 aa PF15612 WHIM1 438-469 aa PF00628 PHD 521-562 aa PF24294 Chromo_PTM 1034-1117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795298.1`	Pfam	`PF21743`	PTM_DIR17_Tudor	Domain	5	53	4.6e-12	46.3	PTM/DIR17-like, Tudor domain
`XP_057795298.1`	Pfam	`PF02791`	DDT	Family	328	381	9.7e-13	48.7	DDT domain
`XP_057795298.1`	Pfam	`PF15612`	WHIM1	Motif	438	469	3.7e-05	23.9	WSTF, HB1, Itc1p, MBD9 motif 1
`XP_057795298.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	521	562	1.2e-07	32.3	PHD-finger
`XP_057795298.1`	Pfam	`PF24294`	Chromo_PTM	Domain	1034	1117	1.4e-20	73.8	Membrane-bound transcription factor PTM, chromo domain-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939315.1
ATGGAGTACGTCGGAAGGAAGGTGAAGAAGGAGTTCCTCGGCCGCGCCGCCTGCTTTGGCGCGGTGGAGGCCTATTCTCCCGCCACCGGTCTGTTTAAAGTCGTCTACGAAGGTGGCGATTCCGAGGAGATGGAGCTGGCGGAGGTTTCGTCGCTTCTCCTCGCGCCGCCGTCGAGTTTGGGCGTGAAGGCCGGGGAGGGAGGCAGCATTGGCCAAAGAGGCGCGTTTGAAGGAAATCCAGAAATCTCCAGCGGCGTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011516
ATGGAGTACGTCGGAAGGAAGGTGAAGAAGGAGTTCCTCGGCCGCGCCGCCTGCTTTGGCGCGGTGGAGGCCTATTCTCCCGCCACCGGTCTGTTTAAAGTCGTCTACGAAGGTGGCGATTCCGAGGAGATGGAGCTGGCGGAGGTTTCGTCGCTTCTCCTCGCGCCGCCGTCGAGTTTGGGCGTGAAGGCCGGGGAGGGAGGCAGCATTGGCCAAAGAGGCGCGTTTGAAGGAAATCCAGAAATCTCCAGCGGCGTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795298.1
MEYVGRKVKKEFLGRAACFGAVEAYSPATGLFKVVYEGGDSEEMELAEVSSLLLAPPSSLGVKAGEGGSIGQRGAFEGNPEISSGVPRDSGRNSAEFDLNICGEIDLNEDGGDRREGGGLGGLHGLDLNEGVNYILHDEFDCNQEETDPVPTVRMFDLNLELDEEAEEISSTKSVRSFDLNVELKEDQSEGQHSQPAMEIDDKGKAAIDDEDDCTIVAHNPPRVVTALPPPPPPPYYGGGGGGGSGWWNNRTALDMELMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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