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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001143`

染色体: Chr02 坐标: 20718475-20724696 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001143`
名称	SmilChr02G001143
描述	uncharacterized SmilChr02G001143
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	20718475 - 20724696 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011524`
GeneID	`131011524`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011524`
原始查询	`LOC131011524`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cell differentiation, Rcd1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821628]; symbol=AT3G20800; hit=AT3G20800; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Cell differentiation, Rcd1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821628]; symbol=AT3G20800; hit=AT3G20800; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G20800` (AT3G20800) Cell differentiation, Rcd1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821628] identity=83; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0613400` - identity=83.9; qcov=0.914; evalue=3.71e-177; confidence=high
GO	GO:0000932 (P-body); GO:0006402 (mRNA catabolic process); GO:0017148 (negative regulation of translation); GO:0030014 (CCR4-NOT complex); GO:0030015 (CCR4-NOT core complex)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04078 (Rcd1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011524

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795290.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057795290.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057795290.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057795290.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057795290.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:20719134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C1
`Chr2:20724181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795290.1

313 aa

156

313

Rcd1

PF04078 Rcd1 37-295 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795290.1`	Pfam	`PF04078`	Rcd1	Repeat	37	295	2.9e-129	430.7	Cell differentiation family, Rcd1-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939307.1
ATATTTGAAACAATTAAGAATATGATTGCTACAAAGTTATGAATTTGTGAAACGAATCACAAATTCACAATGAGTAGATTATAACAACACAATCTTAATAATCCCTAATTATTATCCTAATCCGTCCAAAATATGCATCTCTCCTATAACTCAAAACCCCCTTCCATTTTCCTTTTTATAAGTGTTTCCTACATCTCATTCCCATATCTGCAGTGGCTGCGCGTGTCAAACACCACATCCGGAGTCCACTAACGCATCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011524
ATGGCAACCCTTCCTCCGCCGCTGAACTTGAAAGCCGCCCCCTTTGAGGCTACCGGCAGCTCCTCCTCCGCCGCCAACAAAGACCGCAGGATGCAATCCGCCGAGCAGTTGGTTCTCGATCTCTGCAATCCGGATCTCCGAGAAAATGCTCTGCTCGAACTTTCAAAGAAGAGAGAACTTTTTCAAGATTTGGCTCCATTGCTGTGGAATTCCTTCGGCACCATTGCTGCTCTTCTGCAGGAAATCGTCTCCATTTACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795290.1
MATLPPPLNLKAAPFEATGSSSSAANKDRRMQSAEQLVLDLCNPDLRENALLELSKKRELFQDLAPLLWNSFGTIAALLQEIVSIYPVLSPPNLTPAQSNRVCNALALLQCVASHPDTRMLFLNAHIPLYLYPFLNTTSKSRPFEYLRLTSLGVIGALVKVDDTEVISFLLSTEIIPLCLRTMEMGSELSKTVATFIVQKILLDDVGLEYICTTAERFFAVGRVLGNMVAALAEQPSSRLLKHIIRCYLRLSDNPRACDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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