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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001177`

染色体: Chr02 坐标: 21638013-21644647 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001177`
名称	SmilChr02G001177
描述	probable beta-1,3-galactosyltransferase 2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	21638013 - 21644647 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011559`
GeneID	`131011559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011559`
原始查询	`LOC131011559`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable beta-1,3-galactosyltransferase 2
产物	probable beta-1%2C3-galactosyltransferase 2
Arabidopsis	`AT1G05170` (AT1G05170) Galactosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839292] identity=71.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0577500` - identity=68; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016758 (hexosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01762 (Galactosyl_T); PF13334 (DUF4094)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057795312.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057795312.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795312.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795312.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795312.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:21638657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:21639979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:21640136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B48,B75,C21,D8
`Chr2:21640209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C54
`Chr2:21640214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,C17,C56,C65,D11
`Chr2:21640247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:21643574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:21644214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:21644243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795312.1

405 aa

202

405

DUF4094

Galactosyl_T

PF13334 DUF4094 17-110 aa PF01762 Galactosyl_T 150-347 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795312.1`	Pfam	`PF13334`	DUF4094	Family	17	110	2.1e-27	96.1	Domain of unknown function (DUF4094)
`XP_057795312.1`	Pfam	`PF01762`	Galactosyl_T	Family	150	347	5e-50	170.7	Galactosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939329.1
CAACTAACTGTAGTTGGAAGTAGGTTATTGATGTTATGATTTTGTAATAAATAGTTGAACTTGGGAGTTGAGACTTACAAGTCCAAACAACTTATAAAATTAAAAAATGACAAAATGAAGAAAGAAAACACAAAAAATAAACAGAGAAAGAAAAAGTGAAATGTAGACTTGCAGTACTCCCCTCAAATTCACTGCTTCACAACTCCAACATCTCTCTTTCCTCTTCCTTTTTTCCATTTCAATTCCCTCTCTCGTTGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011559
ATGTCTCTCAAGAGCAGAGGGAGCGAGTCATCTTCGAAGAAAGGCGTTTCAAGAAAGCTCACACTTTTTCTCTGCATTGGATGCTTTTGTGCTGGGATGCTCTTCACCGACAGAATGTCGGCAGTGCCAGAAGCTGAAGACTTATCTCAGTCTACTGGGGTTCCGGATGAAAAGCCTAGCTTAGTTTCAGATGGTTGTGATACAAAAGTTAAGGATGGAAAAAGCGAGTCCAGGGATTTTTTTGCGAAAGTTTCTAAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795312.1
MSLKSRGSESSSKKGVSRKLTLFLCIGCFCAGMLFTDRMSAVPEAEDLSQSTGVPDEKPSLVSDGCDTKVKDGKSESRDFFAKVSKTPHDTEALDRTISDLEMELAATRTLQDSLLGSSPLSQELKNPGLAKKRKYFMVVGINTAFSSRRRRDSLRATWMLQGDKRRKLEEEKGIVIRFVIGHSATSGGILDRAIEAEDKKHGDFLRLEHVEGYLELSAKTKTYFITALTLWDADFYVKVDDDVHVNIATLGATLARHRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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