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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004704`

染色体: Chr01 坐标: 65145804-65147888 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004704`
名称	SmilChr01G004704
描述	uncharacterized SmilChr01G004704
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65145804 - 65147888 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011583`
GeneID	`131011583`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011583`
原始查询	`LOC131011583`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0231700; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0231700; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0231700` - identity=24.5; qcov=0.646; evalue=3.51e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011583

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795340.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795340.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795340.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795340.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795340.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65145837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	60	A16,A2,A20,A24,B104,B113,B114,B115,B117,B124,B126,B127,B129,B132,B14,B17,B2,B30,B33,B48,B5,B53,B57,B6,B82,B83,B87,B89,B9,B91,B94,B95,B98,B99,C1,C13,C18,C19,C24,C27,C28,C34,C4,C42,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C59,C67,C71,C73,C83,C87,D11,D2,D7,D9
`Chr1:65145969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B28,C38,C41,D3
`Chr1:65146002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B35,B66,B99,C60
`Chr1:65146004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B69,C42
`Chr1:65146014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A10,C45,D10
`Chr1:65146014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C45,D10
`Chr1:65146030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B89,D4,D8
`Chr1:65146032`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A13,A14,A7,B104,B108,B121,B127,B22,B24,B29,B32,B66,B71,B75,B81,B85,B89,B9,B91,C22,C29,C32,C35,C63,C68,C85,C87,D4,D8
`Chr1:65146095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:65146106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:65146107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A8,B32
`Chr1:65146128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A10,A16,B105,B108,B11,B115,B122,B131,B137,B17,B32,B33,B42,B53,B62,B68,B85,B94,C12,C15,C19,C21,C23,C26,C45,C47,C5,C55,C74,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939357.1
ATGGATGAAGATTTCCAAGAAGAGTTGGTGGAACAATCAATGGAGGAAACAATAATTTCACAACACGATACGGCTAATGGTGCGCCCAAACGGAATGTCAGAGGTGTTACGAAAGGCTTATCACTCCAAAAGAAATGTCAGCGTACTCCAAAATTAGACGTGATTATACATCCGACAAGAAATCGGATTGTTGGCGAGAATGCTAAAGACTTCAAGACGGAAGCGTGTGTGATGGTAAAGCAATTTGCACAAGTTCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011583
ATGGATGAAGATTTCCAAGAAGAGTTGGTGGAACAATCAATGGAGGAAACAATAATTTCACAACACGATACGGCTAATGGTGCGCCCAAACGGAATGTCAGAGGTGTTACGAAAGGCTTATCACTCCAAAAGAAATGTCAGCGTACTCCAAAATTAGACGTGATTATACATCCGACAAGAAATCGGATTGTTGGCGAGAATGCTAAAGACTTCAAGACGGAAGCGTGTGTGATGGTAAAGCAATTTGCACAAGTTCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795340.1
MDEDFQEELVEQSMEETIISQHDTANGAPKRNVRGVTKGLSLQKKCQRTPKLDVIIHPTRNRIVGENAKDFKTEACVMVKQFAQVQHPRWKDIPMENKRKMWIGMKQKFNLEEDVHVKKVVFAQFNRQYRSYKHKLHVHYLTNKGERTILDKSPHGVNREDWKLLIDYFESDAFKRDPETGEEPTRTAAWRKSRYNNEKKEWVDDTSKEVYEKLIMRQSLPEDGGEPMTEDEAFIKVLGEEKSSRLRGCGDGIKPTSKRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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