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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001215`

染色体: Chr02 坐标: 22360668-22361640 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001215`
名称	SmilChr02G001215
描述	fatty acid desaturase 4, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22360668 - 22361640 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011591`
GeneID	`131011591`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011591`
原始查询	`LOC131011591`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fatty acid desaturase 4, chloroplastic-like
产物	fatty acid desaturase 4%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G27030` (FADA) fatty acid desaturase A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828811] identity=50.4; qcov=0.98; evalue=9.15e-78; confidence=high
Rice	`Os08g0187900` - identity=39.9; qcov=0.943; evalue=3.56e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10520 (Lipid_desat)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011591

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057795341.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057795341.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795341.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795341.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795341.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22360946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr2:22360966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:22360967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B111
`Chr2:22360967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr2:22360983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:22361051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B106,C71
`Chr2:22361051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C71
`Chr2:22361055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C71
`Chr2:22361056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr2:22361067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B15,B89,C80
`Chr2:22361125`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A18,B109,B126,B49,C60,D2
`Chr2:22361222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A9,B110,B75,C45,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795341.1

247 aa

124

247

Lipid_desat

PF10520 Lipid_desat 65-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795341.1`	Pfam	`PF10520`	Lipid_desat	Domain	65	233	1.1e-60	205.4	Lipid desaturase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939358.1
CTCTATAATTTACTTGGAACATATTTCATCACAATTTTTTGATCAGATTTCGACGGCAAATATCTTCATAAATTCTAATCTCCAAACCATTTCTTTCCATTAATTCTCAACTCTCTCTTTCTCCAACATGGAGCTTAAACAGAGGTCAGCCTCGCAAACCCTAAATCAAGAGAGTAATTGGCCCATCACTACCTTCGCTCACCGTGCACGCTTGGCCGCTGGCTGCGCCACCTTGCTATTCTCCATAGCCAAATCCCTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011591
ATGGAGCTTAAACAGAGGTCAGCCTCGCAAACCCTAAATCAAGAGAGTAATTGGCCCATCACTACCTTCGCTCACCGTGCACGCTTGGCCGCTGGCTGCGCCACCTTGCTATTCTCCATAGCCAAATCCCTAGTGCTGACCACCGCCGCTCCACGGGCATGGCTCGAGTCCATGCTTGCCGCCACGGTGGCCTACTTCACGGCGGACCTAGTTACGGGCATTTATCACTGGGCCATAGACAACTACGGCAGCGCCCAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795341.1
MELKQRSASQTLNQESNWPITTFAHRARLAAGCATLLFSIAKSLVLTTAAPRAWLESMLAATVAYFTADLVTGIYHWAIDNYGSAQTPIFGSQIVGFQGHHHRPSQLAKPPVAYNVHIAAAAVTAVVTPINLLCSDPVFLLFVGVFAGCVMFSQQFHAWAHTPKGRLPTLVAMLQDAGIILRRADHAAHHRPPFNNSYCIVSGVWNRVLDRSKFFVALEVVVATALGHEPRSWSDTISDWSEKSGTN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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