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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002581`

染色体: Chr02 坐标: 44859629-44863718 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002581`
名称	SmilChr02G002581
描述	5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like protein COG0212
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	44859629 - 44863718 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011639`
GeneID	`131011639`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011639`
原始查询	`LOC131011639`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like protein COG0212
产物	5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase-like protein COG0212
Arabidopsis	`AT1G76730` (COG0212) NagB/RpiA/CoA transferase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844007] identity=74.2; qcov=0.812; evalue=1.29e-164; confidence=high
Rice	`Os12g0168000` - identity=73.5; qcov=0.761; evalue=3.49e-147; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	smil00670 (One carbon pool by folate - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04981 (Folate transport and metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01812 (5-FTHF_cyc-lig)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011639

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795393.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057795393.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057795393.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795393.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795393.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:44859937`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B78
`Chr2:44859937`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B78
`Chr2:44859970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C47
`Chr2:44860189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:44861300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:44863208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,C62,C78,C8
`Chr2:44863253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795393.1

372 aa

186

372

5-FTHF_cyc-lig

PF01812 5-FTHF_cyc-lig 108-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795393.1`	Pfam	`PF01812`	5-FTHF_cyc-lig	Domain	108	309	9.8e-37	127.4	5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939410.1
CGTTTGGTTAGAAATCAGCCAAACACGACCTGAAGAAACCAAAAGCAAAAAAAGAAATCAGCCAAACGCGATTCTTGAGATGAGAAACCGCGACATCATCCAACATGGCTTCGCGAGTCCCAACCGCCATTTTTGTATGGATGTGCAATTGCTCAAGCTCTCTCACGCATCTCCGCTGTCAATCAAATGGACTCCTGCTTCCAGTTCCAGACCACCCCTTAACCTCCCTTCAATTTCCCGGACAATAACCCCTATTTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011639
ATGAGAAACCGCGACATCATCCAACATGGCTTCGCGAGTCCCAACCGCCATTTTTGTATGGATGTGCAATTGCTCAAGCTCTCTCACGCATCTCCGCTGTCAATCAAATGGACTCCTGCTTCCAGTTCCAGACCACCCCTTAACCTCCCTTCAATTTCCCGGACAATAACCCCTATTTCCCCACTGTTTTCGAGAACGACGGCCTCCCGCCGCAGCGACGCCACTTTCGACGAGGCGGCGTACGAGGCGAAGCGGCTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795393.1
MRNRDIIQHGFASPNRHFCMDVQLLKLSHASPLSIKWTPASSSRPPLNLPSISRTITPISPLFSRTTASRRSDATFDEAAYEAKRLSLDAAARESMAEKSAVEGDDPKAWKWVIRKRVWDFMEARNIAQFPRPVHHRIPNFVGAHIAAQKLSELQVFKEAKCVKVNPDTPQKQVRFLTLNGGKKLLTPQPRLRTGFFSILEYSMLIPETIKEACTSVGVAKYGKPIGLEEKIKVDLIVVGSVAVDPKTGARLGKGEGFAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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