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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002597`

染色体: Chr02 坐标: 45112709-45114827 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002597`
名称	SmilChr02G002597
描述	phospholipase A1-II 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	45112709 - 45114827 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011652`
GeneID	`131011652`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011652`
原始查询	`LOC131011652`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase A1-II 1-like
产物	phospholipase A1-II 1-like
Arabidopsis	`AT4G18550` (DSEL) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827587] identity=54.7; qcov=0.947; evalue=1.21e-157; confidence=high
Rice	`Os05g0574000` - identity=51.4; qcov=0.971; evalue=1.83e-132; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008970 (glycerophospholipid phospholipase A1 activity)
KEGG	-
Pfam	PF01764 (Lipase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011652

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057795413.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057795413.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795413.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795413.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795413.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:45112760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B16,C86
`Chr2:45112775`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B93
`Chr2:45112775`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B93
`Chr2:45112806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B62,C60,C61,C62
`Chr2:45112877`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B16,B69,C26
`Chr2:45112877`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B16,B69,C26
`Chr2:45112883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B108
`Chr2:45113021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C86,D9
`Chr2:45113117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B47,C56,C65,C85
`Chr2:45113124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,C27,C44
`Chr2:45113142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:45113174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B29,C37,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795413.1

417 aa

208

417

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 158-316 aa

XP_057795414.1

417 aa

208

417

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 158-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795413.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	158	316	3.5e-35	121.7	Lipase (class 3)
`XP_057795414.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	158	316	3.5e-35	121.7	Lipase (class 3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939430.1
GAGTTTTGTAAATACCCTTAACATGATTCTTTAATTGTCGTTTTATCACAAACTGTGTTTTCATATAATAAATAGATAAGTTTGAGGCACGGAAAATTAATTGCTTCGGCACATAATCACATGAGTCGAATAATGCAAAATCGTCATTTTTAACAGATTTTGGGAAGTTAATCTTTGCTTATACGTTGAGTGCATGGTTCAGCCTTCAAATCCAAAATAGACATTTGCATTTACACTAATTTTACAACAATCTCGGAACC...

XM_057939431.1
ATGAAGGTGCATGAAACAAATCTTGAGCAATTTTCGTGCATGAATTATGAAAACCACAATTGTAAGAGATCTGCATTTGCTTAATTGGTTCAGGCATGATCTTGAGTAGTTTCAATTGGGGGAAGAGAGAGATAGTCGCGGGAGACAAGGGCATTGCCGCCGGAGAAGGAAGCATCGGCCAGAGATGGAAGCTTCTGAGTGGGGAAAAGAAATGGGAAGGTTTATTAGACCCTTTAGACAACGATCTGCGTCGCTACATA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011652
ATGATCTTGAGTAGTTTCAATTGGGGGAAGAGAGAGATAGTCGCGGGAGACAAGGGCATTGCCGCCGGAGAAGGAAGCATCGGCCAGAGATGGAAGCTTCTGAGTGGGGAAAAGAAATGGGAAGGTTTATTAGACCCTTTAGACAACGATCTGCGTCGCTACATACTTCATTATGGAACGATGGCCGAGGTGACCTACGACGCTTTCATATCCGAGGAGGCATCGAGATACGCAGGGAGCTGCAGATATGCAAAGAAAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795413.1
MILSSFNWGKREIVAGDKGIAAGEGSIGQRWKLLSGEKKWEGLLDPLDNDLRRYILHYGTMAEVTYDAFISEEASRYAGSCRYAKKDLFTKVGIDNGNPFKYRVTKYLYATSSTPVAGALFITSWSRESWTRESNWMGYVAVATDQGKSAIGRRDILIAWRGTVQNLEWVNDLEFNLTTAHEIFGGSDEPKVHFGWHSVYTCADPKSPFNKTSARHQVLGEVRRLVELYKNEEISITITGHSLGGAVSTLNAVDIVVNGY...

XP_057795414.1
MILSSFNWGKREIVAGDKGIAAGEGSIGQRWKLLSGEKKWEGLLDPLDNDLRRYILHYGTMAEVTYDAFISEEASRYAGSCRYAKKDLFTKVGIDNGNPFKYRVTKYLYATSSTPVAGALFITSWSRESWTRESNWMGYVAVATDQGKSAIGRRDILIAWRGTVQNLEWVNDLEFNLTTAHEIFGGSDEPKVHFGWHSVYTCADPKSPFNKTSARHQVLGEVRRLVELYKNEEISITITGHSLGGAVSTLNAVDIVVNGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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