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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002635`

染色体: Chr02 坐标: 45721229-45723008 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002635`
名称	SmilChr02G002635
描述	probable mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26c
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	45721229 - 45723008 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011678`
GeneID	`131011678`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011678`
原始查询	`LOC131011678`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26c
产物	probable mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26c
Arabidopsis	`AT5G09850` (AT5G09850) Transcription elongation factor (TFIIS) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830845] identity=37.2; qcov=0.959; evalue=1.64e-43; confidence=medium
Rice	`Os12g0165700` (OsTFIIS-like) - identity=39.9; qcov=0.689; evalue=1.37e-33; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF08711 (Med26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011678

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795445.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057795446.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795445.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795445.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795445.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:45721588`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B131,C67,C74
`Chr2:45721588`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B131,C67,C74
`Chr2:45721609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B122,C60,C61
`Chr2:45721810`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A18,C61
`Chr2:45721810`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A18,C61
`Chr2:45722123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr2:45722427`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B131,C30,C40
`Chr2:45722427`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B131,C30,C40
`Chr2:45722827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B39,C13,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795445.1

254 aa

127

254

Med26

PF08711 Med26 103-153 aa

XP_057795446.1

253 aa

126

253

Med26

PF08711 Med26 103-153 aa

XP_057795447.1

245 aa

122

245

Med26

PF08711 Med26 103-153 aa

XP_057795448.1

244 aa

122

244

Med26

PF08711 Med26 103-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795445.1`	Pfam	`PF08711`	Med26	Domain	103	153	3.8e-14	52.9	TFIIS helical bundle-like domain
`XP_057795446.1`	Pfam	`PF08711`	Med26	Domain	103	153	3.8e-14	52.9	TFIIS helical bundle-like domain
`XP_057795447.1`	Pfam	`PF08711`	Med26	Domain	103	153	3.6e-14	53.0	TFIIS helical bundle-like domain
`XP_057795448.1`	Pfam	`PF08711`	Med26	Domain	103	153	3.6e-14	53.0	TFIIS helical bundle-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097074.1
ATAAATAAATAAAAATTGAAATAAAACACTGTTAATTCCAACTTCATTCATTCCGAAATGAACAGGATTCTACCAACACATTTTTGGGATTTGTTCCTTTATCTCTTCTCCTCCAGCTAAAATTAACTTGAGATAAAATTTTGAAAAATCAGTTGCAGGAATTTGGTTTATGGATTTGAACGAGTTTCGCTCCGTCATGTCGGATTCCGGCATTGATGTCTGGACTTGGATCGATATGGCGATATCCGTGGCGTCTGCTG...

XR_009097073.1
ATAAATAAATAAAAATTGAAATAAAACACTGTTAATTCCAACTTCATTCATTCCGAAATGAACAGGATTCTACCAACACATTTTTGGGATTTGTTCCTTTATCTCTTCTCCTCCAGCTAAAATTAACTTGAGATAAAATTTTGAAAAATCAGTTGCAGGAATTTGGTTTATGGATTTGAACGAGTTTCGCTCCGTCATGTCGGATTCCGGCATTGATGTCTGGACTTGGATCGATATGGCGATATCCGTGGCGTCTGCTG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131011678
ATGGATTTGAACGAGTTTCGCTCCGTCATGTCGGATTCCGGCATTGATGTCTGGACTTGGATCGATATGGCGATATCCGTGGCGTCTGCTGATCATGAAATCGAGCTCCGGAATCGCAGAGATGGAATTGTTCAGAAGCTCTTTGCATCGCCATGTGAGAATTGTGTGAAGAGGAATGAGAGTGATCAGCAAAATCATCAAGGAATCCAACCAGATAAAAATGTGGAACACGATGATGAGCACAGGAAGATTCTACAAAT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057795445.1
MDLNEFRSVMSDSGIDVWTWIDMAISVASADHEIELRNRRDGIVQKLFASPCENCVKRNESDQQNHQGIQPDKNVEHDDEHRKILQIKNLLDDHSQNEKSMIELLQRLLDMNTTFTTLKETEIGKHVTKLRKHSSNEVRRLVKVLVRKWRDTVDEWVRQNTPIEEEATEFNDQASYLFAKDDARIHNSVKDVSCHSTPPKRKAKDNGIILNDEDYQESQYAKKQRRPQPQVMDIPKFKNSIVPNNGGSVPIKYW

XP_057795446.1
MDLNEFRSVMSDSGIDVWTWIDMAISVASADHEIELRNRRDGIVQKLFASPCENCVKRNESDQQNHQGIQPDKNVEHDDEHRKILQIKNLLDDHSQNEKSMIELLQRLLDMNTTFTTLKETEIGKHVTKLRKHSSNEVRRLVKVLVRKWRDTVDEWVRQNTPIEEEATEFNDQASYLFAKDDARIHNSVKDVSCHSTPPKRKAKDNGIILNDEDYQESQYAKKQRRPQPQVMDIPKFKNSIVPNNGGSVPIKY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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