当前解析结果
SmilChr02G002637| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002637 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002637 |
| 描述 | UPF0496 protein At3g49070-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 45763583 - 45764729 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011680 |
|---|---|
| GeneID | 131011680 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011680 |
| 原始查询 | LOC131011680 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UPF0496 protein At3g49070-like |
| 产物 | UPF0496 protein At3g49070-like |
| Arabidopsis | AT3G49070 (AT3G49070)transmembrane protein, putative (DUF677) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824069] identity=32.5; qcov=1.26; evalue=1.48e-32; confidence=low |
| Rice | Os03g0148000- identity=27.2; qcov=1.31; evalue=3.27e-23; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011680 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795449.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057795449.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057795449.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795449.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795449.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:45763972 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B14,B64,C68 |
Chr2:45764014 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B14,B64,B66,C68 |
Chr2:45764153 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,C58 |
Chr2:45764203 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,B1,B17,C41,D4 |
Chr2:45764488 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr2:45764557 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C25,C6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。