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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004743`

染色体: Chr01 坐标: 65611703-65613208 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004743`
名称	SmilChr01G004743
描述	putative UPF0481 protein At3g02645
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65611703 - 65613208 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011686`
GeneID	`131011686`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011686`
原始查询	`LOC131011686`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative UPF0481 protein At3g02645
产物	putative UPF0481 protein At3g02645
Arabidopsis	`AT3G02645` (AT3G02645) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723101] identity=48.9; qcov=0.98; evalue=3.44e-152; confidence=high
Rice	`Os06g0179500` - identity=42.9; qcov=1.12; evalue=3.45e-139; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011686

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057795461.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795461.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795461.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795461.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795461.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65611859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B81
`Chr1:65612110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:65612135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B73
`Chr1:65612168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:65612282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B88,C37,C40
`Chr1:65612316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:65612386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B83,B84,C59,C79
`Chr1:65612463`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B59,C41,C76
`Chr1:65612463`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B59,C41,C76
`Chr1:65612704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B139
`Chr1:65612738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:65612765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795461.1

501 aa

250

501

DUF247

PF03140 DUF247 37-477 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795461.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	37	477	2.7e-101	340.5	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939478.1
ATGTTACCAAATCCAAGCTTTGACGAACATCGTTGGGTGATCCACATTCGTAAAGCATTAGACAATGAAGATGATGATCTACAACAAGAATCCCATATCTATGCCTCAATCTTCAACGTTCCCAAAACACTTGTGCTCACCAGCCCGGAATCCTACGTGCCACAGCTAGTAGCGTTAGGCCCGTACCACCACTCCCGGCCCGAACTATACCAGATGGAAAGGTACAAGCTCTCTGCAGCCCAAAGATCACAAAAAAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011686
ATGTTACCAAATCCAAGCTTTGACGAACATCGTTGGGTGATCCACATTCGTAAAGCATTAGACAATGAAGATGATGATCTACAACAAGAATCCCATATCTATGCCTCAATCTTCAACGTTCCCAAAACACTTGTGCTCACCAGCCCGGAATCCTACGTGCCACAGCTAGTAGCGTTAGGCCCGTACCACCACTCCCGGCCCGAACTATACCAGATGGAAAGGTACAAGCTCTCTGCAGCCCAAAGATCACAAAAAAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795461.1
MLPNPSFDEHRWVIHIRKALDNEDDDLQQESHIYASIFNVPKTLVLTSPESYVPQLVALGPYHHSRPELYQMERYKLSAAQRSQKNIPLKLHNLVHQLSRAEHRLRACYHKFLNLNGDTLAWMMAVDSCFLLDFLEGKSGQEPGLHDTLLRDILMLENQVPLFSLKKTLEFLSGSADGADDRLYAMAIGLCRDVSPFVIVQESDGVDQINRSTHLLEFLYNLIVPRSSEITLELDEDEQGPNKARADPFSLMKRLVSSKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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