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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002648`

染色体: Chr02 坐标: 45871242-45872475 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002648`
名称	SmilChr02G002648
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g59200-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	45871242 - 45872475 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011690`
GeneID	`131011690`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011690`
原始查询	`LOC131011690`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g59200-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g59200-like
Arabidopsis	`AT5G41840` (AT5G41840) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834189] identity=29.8; qcov=0.511; evalue=5.73e-14; confidence=low
Rice	`Os08g0196900` (OsFBX270) - identity=25.2; qcov=0.514; evalue=2.45e-07; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011690

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795466.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795466.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795466.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795466.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795466.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:45871332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B36,B40,B69,C74
`Chr2:45871372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:45871800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:45871833`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr2:45871833`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr2:45871889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:45872077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B69
`Chr2:45872136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:45872180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C21
`Chr2:45872268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C16
`Chr2:45872313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795466.1

401 aa

200

401

LRR_At5g56370

PF24758 LRR_At5g56370 188-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795466.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	188	260	1.2e-14	55.2	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939483.1
CCATCCAAATTTTGAAGGCTTTCATCACATGGGGAATATTGATCACAGCAAAATCACCCTAAAAAACCATCCAAAATTTGGAGGTTTTCATCACATGGGGAATGATGACAGCAAAATCGCGGCAGATGGCGAATCCGGCAAACTTCCAGAAGAAATCACGGCGAATGATCACAGCAAAACTGCTGCAGATGCAGATGGCGAATCCGACAAGCTTCCACAAGAAATCATTCAGCACATACAATCTCTTCTGCTTGAAAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011690
ATGGGGAATATTGATCACAGCAAAATCACCCTAAAAAACCATCCAAAATTTGGAGGTTTTCATCACATGGGGAATGATGACAGCAAAATCGCGGCAGATGGCGAATCCGGCAAACTTCCAGAAGAAATCACGGCGAATGATCACAGCAAAACTGCTGCAGATGCAGATGGCGAATCCGACAAGCTTCCACAAGAAATCATTCAGCACATACAATCTCTTCTGCTTGAAAAAGAAGCTGCTCGAACCTCTCTCCTATCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795466.1
MGNIDHSKITLKNHPKFGGFHHMGNDDSKIAADGESGKLPEEITANDHSKTAADADGESDKLPQEIIQHIQSLLLEKEAARTSLLSKSWHGAWTTRPNLSFDQSKFRNCVDEFPIFTKKTMQRCQDLNLNIKSFKLTISSKKKTMQSSKPRIEKGNDDSELARELILRAIKLGATDLTIELPFSEARRFFVLPDEVLESKTLVRLSVSGLLIDLERRNKAVACPNLKHLWLSHSSVKGDLVRDLISRCPGIEVLTLTHTR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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