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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002665`

染色体: Chr02 坐标: 46148463-46150262 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002665`
名称	SmilChr02G002665
描述	extensin-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	46148463 - 46150262 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011703`
GeneID	`131011703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011703`
原始查询	`LOC131011703`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	extensin-like
产物	extensin-like
Arabidopsis	`AT1G21310` (EXT3) extensin 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838728] identity=51.2; qcov=0.945; evalue=5.35e-20; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005199 (structural constituent of cell wall); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF04554 (Extensin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057795483.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057795483.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795483.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795483.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795483.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:46148495`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C7
`Chr2:46148495`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C7
`Chr2:46148549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:46148606`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	3	B76,C14,C33
`Chr2:46148606`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B76,C14,C33
`Chr2:46148682`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B48
`Chr2:46148682`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B48
`Chr2:46148700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B132,B48,B76
`Chr2:46148714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr2:46148798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,D11
`Chr2:46148872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr2:46149110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795483.1

453 aa

226

453

Extensin_2

PF04554 Extensin_2 47-82 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795483.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	47	82	1.9e-48	163.1	Extensin-like region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939500.1
ACCGAATCTATAAAAATGGGCGGGAGTGGAGTAGAAAGGAACAACAACAAACCCAAAACCCCAAAGATGGGAACAAAAGCGAAGATGGCATCCTCTCTCACCGCCACTTTGGTGGTGGCACTGCTTGCTATCTGCTTGCCTGCAATAGCCAATGCCAACTACCACTATGCTTCTCCTCCACCACCCTACCACTACTCATCTCCGCCGCCGCCGGTCCACTCCCCCCCACCTCCCTACGTCTACAAGTCACCCCCACCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011703
ATGGGCGGGAGTGGAGTAGAAAGGAACAACAACAAACCCAAAACCCCAAAGATGGGAACAAAAGCGAAGATGGCATCCTCTCTCACCGCCACTTTGGTGGTGGCACTGCTTGCTATCTGCTTGCCTGCAATAGCCAATGCCAACTACCACTATGCTTCTCCTCCACCACCCTACCACTACTCATCTCCGCCGCCGCCGGTCCACTCCCCCCCACCTCCCTACGTCTACAAGTCACCCCCACCCCCACCCTATGTGTACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795483.1
MGGSGVERNNNKPKTPKMGTKAKMASSLTATLVVALLAICLPAIANANYHYASPPPPYHYSSPPPPVHSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPKHHYVYKSPPPPTPVYKYKSPPPPPKHPYVYKSPPPPTPVYKYKSPPPPPKHPYVYKSPPPPTPVYKYKSPPPPPKHPYVYKSPPPPTPVYKYKSPPPPPKHPYVYKSPPPPTPVYKYKSPPPPPKHPYVYKSPPPPTPVYKYKSPPPPPKHPYVYKSPPPPTPVYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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