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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002685`

染色体: Chr02 坐标: 46492953-46495890 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002685`
名称	SmilChr02G002685
描述	probable metal-nicotianamine transporter YSL7
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	46492953 - 46495890 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011716`
GeneID	`131011716`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011716`
原始查询	`LOC131011716`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable metal-nicotianamine transporter YSL7
产物	probable metal-nicotianamine transporter YSL7
Arabidopsis	`AT1G65730` (YSL7) YELLOW STRIPE like 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842884] identity=65.9; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0524900` (OsYSL11) - identity=61.6; qcov=0.944; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0035673 (oligopeptide transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03169 (OPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011716

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057795501.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057795501.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057795501.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795501.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795501.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:46493007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr2:46493166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:46493303`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A10,A14,A23,A9,B1,B10,B103,B105,B109,B110,B114,B118,B119,B123,B133,B134,B14,B3,B30,B31,B35,B57,B58,B85,B98,C1,C10,C16,C24,C3,C33,C36,C38,C39,C51,C53,C62,C64,C66,C77,C9,D1
`Chr2:46493450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B82,D3
`Chr2:46493479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B82,D3
`Chr2:46493808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:46493959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:46494015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr2:46494025`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A1,B101,B138,B20,B25,B44,B59,B64,B7,C13,C59,C6
`Chr2:46494326`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B50,B93,C18,C2,C86
`Chr2:46494326`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B50,B93,C18,C2,C86
`Chr2:46494378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B69,B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795501.1

720 aa

360

720

OPT

PF03169 OPT 57-692 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795501.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	57	692	2.4e-151	506.2	OPT oligopeptide transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939518.1
ATGGGCAATGCAAGTGAAATCAATGTGGTGGAGGATGAAAGCAGCATAGAATGTGGAAAACAAAAAAGCGAAGAAAACTTGAAAAAAGGAGAAGCAAAAGAATTGGAAGATGAAGAGTTATCTGTGGAGAGGATGTTCGAAAACAAGGAGGCGTCATCATGGAGGAAGCAGTTGAGTGTGAGAGCCTTTGCTGTAGGCTTTCTGCTGTCACTACTGTTCAGCTGCATAGTGATGAAACTCAACCTCACCACTGGAATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011716
ATGGGCAATGCAAGTGAAATCAATGTGGTGGAGGATGAAAGCAGCATAGAATGTGGAAAACAAAAAAGCGAAGAAAACTTGAAAAAAGGAGAAGCAAAAGAATTGGAAGATGAAGAGTTATCTGTGGAGAGGATGTTCGAAAACAAGGAGGCGTCATCATGGAGGAAGCAGTTGAGTGTGAGAGCCTTTGCTGTAGGCTTTCTGCTGTCACTACTGTTCAGCTGCATAGTGATGAAACTCAACCTCACCACTGGAATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795501.1
MGNASEINVVEDESSIECGKQKSEENLKKGEAKELEDEELSVERMFENKEASSWRKQLSVRAFAVGFLLSLLFSCIVMKLNLTTGIIPSLNISAALLGFFFVKIWTKLMAKFGMLTHPFTRQENTVIQTCVTASSGIAFSGGFGSYLLAMSERVAKQSEDSRDGLDYKNISLGWMIIFLAAVSFLGLFCVAPLSKVMIINFKLTYPSATATANLINSFHTPQGVKLAKKQVRELGKFFSYTFLWGFFQWFFQTEDDCGFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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