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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002687`

染色体: Chr02 坐标: 46549283-46552267 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002687`
名称	SmilChr02G002687
描述	trihelix transcription factor DF1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	46549283 - 46552267 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011720`
GeneID	`131011720`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011720`
原始查询	`LOC131011720`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	trihelix transcription factor DF1-like
产物	trihelix transcription factor DF1-like
Arabidopsis	`AT1G76890` (GT2) Duplicated homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844024] identity=48.7; qcov=0.882; evalue=2.97e-145; confidence=high
Rice	`Os04g0541100` (GT-2) - identity=47.2; qcov=0.544; evalue=4.13e-71; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10545 (MADF_DNA_bdg); PF13837 (Myb_DNA-bind_4); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011720

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795505.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795505.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795505.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795505.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795505.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:46549606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B6,C63
`Chr2:46549616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B108,B5
`Chr2:46549639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B108,B5
`Chr2:46549676`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C26
`Chr2:46549676`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C26
`Chr2:46550676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr2:46550759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B134
`Chr2:46550760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C43,D9
`Chr2:46550861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C26
`Chr2:46550902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B82,D3
`Chr2:46550904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C43,D9
`Chr2:46551085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795505.1

561 aa

280

561

Myb_DNA-bind_4

Myb_DNA-bind_6

MADF_DNA_bdg

PF13837 Myb_DNA-bind_4 53-139 aa PF13837 Myb_DNA-bind_4 393-480 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 395-455 aa PF10545 MADF_DNA_bdg 413-478 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795505.1`	Pfam	`PF13837`	Myb_DNA-bind_4	Domain	53	139	1.8e-47	160.4	Myb/SANT-like DNA-binding domain
`XP_057795505.1`	Pfam	`PF13837`	Myb_DNA-bind_4	Domain	393	480	1.8e-47	160.4	Myb/SANT-like DNA-binding domain
`XP_057795505.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	395	455	5.9e-07	30.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057795505.1`	Pfam	`PF10545`	MADF_DNA_bdg	Domain	413	478	5.1e-07	30.7	Alcohol dehydrogenase transcription factor Myb/SANT-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939522.1
CTCTCTCTCTCTCTCTATAGTTTAAAATATAATTTGAGGGGTGTGAGATTGACAGGCAGATCCCACCGAAATAAATTAAATAAATTCACCACGCTCTCTATCTTGATAAAAACCCACAGAATTCACCCAACATATGTGATATATATTTTATTTATTAATTTTTATTTTTATTTGAGCTGGTAATTGGAGGGGAGCTAGCAGCTAGCTGGAAAACGAAGACTCCTTTTACATGATGCTTGGGGTTTCAGGCCTCATCGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011720
ATGATGCTTGGGGTTTCAGGCCTCATCGCCACCTCCGCCGCGGACAACCACGAGAGCGGCGGAGCTAGTGGCGGCAGCAGCGAGGTTGGAGCGTCGAGCTCCGCCCTAGCAGGCGGCGTGGATGAGAGTGAAAGAGTTGGGCAGGGCGGCGGCGGAAACCGGTGGCCGAGGCAGGAGACTTTGGCCTTACTCAAAATTCGGTCTGATATGGATGTTACCTTTCGAGATGCAAGCCTTAAAGGCCCATTATGGGAAGAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795505.1
MMLGVSGLIATSAADNHESGGASGGSSEVGASSSALAGGVDESERVGQGGGGNRWPRQETLALLKIRSDMDVTFRDASLKGPLWEEVSRKLAELGFQRSAKKCKEKFENVFKYHKRTKDGRASKQDAKAYRFFDQLEALENTSPNNHHFSPPPPPRLQPPPSVAMVSTAATPMPSHVTVPSASPTPLSVVPPKNIATVHPITSSPFQQSHQPQPQPQQQLPPYPHPLSNSTSSSTSSDEDIQRRRGRKRKWKEYFEKLMT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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