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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002714`

染色体: Chr02 坐标: 46983804-46987494 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002714`
名称	SmilChr02G002714
描述	serine carboxypeptidase-like 42
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	46983804 - 46987494 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011747`
GeneID	`131011747`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011747`
原始查询	`LOC131011747`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine carboxypeptidase-like 42
产物	serine carboxypeptidase-like 42
Arabidopsis	`AT5G42240` (scpl42) serine carboxypeptidase-like 42 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834229] identity=81.2; qcov=0.959; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0213600` (OsSCP48) - identity=76.9; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004185 (serine-type carboxypeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00450 (Peptidase_S10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011747

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057795557.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795557.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795557.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795557.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795557.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:46984379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:46984382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:46984386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B35
`Chr2:46984386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:46984411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:46984442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B123,B130,B132,B139
`Chr2:46984528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B51
`Chr2:46985825`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	141	A1,A11,A13,A15,A19,A2,A20,A21,A22,A25,A3,A6,A7,A8,B1,B101,B103,B108,B109,B110,B113,B114,B115,B117,B12,B120,B121,B123,B124,B125,B126,B127,B13,B130,B131,B132,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B27,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B37,B40,B44,B46,B47,B49,B52,B53,B54,B55,B58,B6,B60,B61,B64,B65,B66,B7,B72,B75,B76,B77,B78,B79,B81,B86,B87,B9,B90,B91,B93,B98,B99,C10,C11,C12,C16,C19,C2,C21,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C31,C34,C35,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C50,C52,C54,C56,C57,C58,C6,C61,C64,C65,C66,C67,C69,C72,C73,C75,C79,C80,C81,C85,C87,C9,D2,D8,D9
`Chr2:46985827`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	137	A1,A11,A13,A15,A19,A2,A20,A21,A22,A25,A3,A7,A8,B1,B101,B103,B108,B109,B110,B113,B114,B115,B117,B120,B121,B123,B124,B125,B126,B127,B13,B130,B131,B132,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B27,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B37,B40,B44,B46,B47,B49,B52,B53,B54,B55,B58,B6,B60,B61,B64,B65,B66,B7,B72,B75,B76,B77,B78,B79,B81,B86,B87,B9,B90,B93,B98,B99,C10,C11,C12,C16,C19,C2,C21,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C31,C34,C35,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C50,C52,C54,C56,C57,C58,C6,C61,C64,C65,C66,C67,C69,C72,C75,C79,C80,C81,C85,C87,C9,D2,D8,D9
`Chr2:46986370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B26,C22,C5,C58
`Chr2:46986473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C82
`Chr2:46987252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795557.1

467 aa

234

467

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 31-454 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795557.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	31	454	1.3e-131	440.6	Serine carboxypeptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939574.1
TAAATTCAAATCTAGAATTACAAAGGAAGTGGCCCCCCCCATTTCACTTGAGCCGTAGCTCATTGATGGCCCCTTTTCTACACACAGTGAGTGAGTGAGGCTTCTTCTGCTGCTCTGCTTCTGCTGCTTTCCAACGTCTCTCTGCCTCTGGGCTCTGATCATTCAATTTCACCCTCTCTCTCTTTCCATAACAAACTTCTGATACGATGAGATAAGAACAAAAACCCATTACACCAATCCAAATATCCTCGCCTCAATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011747
ATGGGACTGCGGTGGTGGCTGGCGGTGGTGGCGGGATTGGTGGTTGGGGGTGTTTATGGCTTCCCGGAGGAGGATCTAGTGGTGAAATTGCCAGGTCAGCCGGCGGTGAAGTTTAGGCAGTATGCAGGCTATGTCGACGTCGATGTGAAAAAGGGGAGGAGTTTGTTTTACTATTTTGTGGAAGCTGCTGATGAACCTGATCACAAGCCCTTAACTTTATGGCTCAATGGAGGTCCGGGTTGCTCATCAATGGGAGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795557.1
MGLRWWLAVVAGLVVGGVYGFPEEDLVVKLPGQPAVKFRQYAGYVDVDVKKGRSLFYYFVEAADEPDHKPLTLWLNGGPGCSSMGGGAFTELGPFFPIGDGRSLRINSRSWNKASNLLFVESPAGVGWSYSNTSSDYNCGDASTAMDMHLFMMGWYRKFPTFRTRDLFLTGESYAGHYIPQLAIALLDHNEHSKDFKFNIKGVAIGNPLLRLDRDVPATYEFFWSHGMISDEVGLAIMSDCDFDDYTFASPHNVSKSCNE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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