当前解析结果
SmilChr01G000361| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000361 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000361 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000361 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 7426246 - 7428349 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011750 |
|---|---|
| GeneID | 131011750 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011750 |
| 原始查询 | LOC131011750 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=28.4; qcov=0.135; evalue=1.24e-07; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011750 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057795599.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057795599.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.40000 | XP_057795599.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.40000 | XP_057795599.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057795599.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:7426277 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,C1 |
Chr1:7426293 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C4 |
Chr1:7426294 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B111,C25,D2,D3 |
Chr1:7426294 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B111,C25,D2,D3 |
Chr1:7426315 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C25 |
Chr1:7426315 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C25 |
Chr1:7426322 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B73,C59,C78,C84 |
Chr1:7426395 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr1:7426398 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B103,C30,C35,C75 |
Chr1:7426427 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,C62 |
Chr1:7426470 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A4,B47 |
Chr1:7426471 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A18,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。