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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002784`

染色体: Chr02 坐标: 47920800-47924013 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002784`
名称	SmilChr02G002784
描述	probable methyltransferase PMT10
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47920800 - 47924013 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011813`
GeneID	`131011813`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011813`
原始查询	`LOC131011813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable methyltransferase PMT10
产物	probable methyltransferase PMT10
Arabidopsis	`AT5G06050` (AT5G06050) Putative methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830492] identity=59.5; qcov=0.835; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0846600` - identity=59.5; qcov=0.86; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005768 (endosome); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0008168 (methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03141 (Methyltransf_29)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011813

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057795644.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795644.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795644.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795644.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795644.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47921092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:47921278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C34
`Chr2:47921308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:47921422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B82,C43
`Chr2:47921471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B51,B77,B91,D2
`Chr2:47921676`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	100	A14,A18,A2,A3,A4,A6,A8,B1,B100,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B11,B111,B112,B115,B117,B121,B122,B124,B125,B127,B129,B130,B134,B140,B15,B19,B2,B20,B23,B25,B26,B33,B37,B39,B40,B43,B48,B51,B52,B60,B61,B63,B65,B66,B68,B70,B71,B72,B74,B8,B80,B82,B84,B86,B87,B92,B96,B97,B99,C1,C10,C13,C17,C18,C19,C20,C22,C28,C29,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C4,C46,C5,C54,C57,C58,C59,C60,C64,C67,C68,C69,C71,C73,C75,C76,C83,D1,D7,D8
`Chr2:47921694`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	98	A14,A2,A22,A3,A4,A6,A8,B100,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B11,B111,B112,B115,B117,B121,B122,B125,B127,B129,B130,B134,B140,B15,B16,B19,B2,B20,B23,B25,B26,B37,B39,B40,B43,B48,B51,B52,B54,B61,B62,B63,B65,B66,B68,B70,B71,B74,B8,B80,B82,B84,B86,B87,B92,B96,B97,B99,C1,C10,C17,C18,C19,C20,C22,C29,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C4,C46,C5,C54,C57,C59,C6,C60,C64,C67,C68,C69,C71,C73,C75,C76,C83,C84,D1,D7,D8
`Chr2:47921705`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	96	A14,A2,A22,A3,A6,A8,B1,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B108,B111,B115,B117,B121,B122,B125,B127,B129,B130,B134,B137,B140,B15,B16,B19,B2,B20,B23,B25,B26,B32,B37,B39,B40,B43,B48,B51,B52,B54,B61,B62,B63,B65,B66,B68,B70,B71,B74,B8,B82,B86,B87,B92,B96,B97,B99,C1,C17,C18,C20,C24,C28,C29,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C4,C46,C5,C50,C54,C57,C59,C6,C60,C64,C67,C68,C69,C71,C73,C75,C76,C83,C84,C85,D1,D7,D8
`Chr2:47921706`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	96	A14,A2,A22,A3,A6,A8,B1,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B108,B111,B115,B117,B121,B122,B125,B127,B129,B130,B134,B137,B140,B15,B16,B19,B2,B20,B23,B25,B26,B32,B37,B39,B40,B43,B48,B51,B52,B54,B61,B62,B63,B65,B66,B68,B70,B71,B74,B8,B82,B86,B87,B92,B96,B97,B99,C1,C17,C18,C20,C24,C28,C29,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C4,C46,C5,C50,C54,C57,C59,C6,C60,C64,C67,C68,C69,C71,C73,C75,C76,C83,C84,C85,D1,D7,D8
`Chr2:47921721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr2:47921750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B117,C1,D1,D7
`Chr2:47921957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A9,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795644.1

600 aa

300

600

Methyltransf_29

PF03141 Methyltransf_29 129-598 aa

XP_057795645.1

565 aa

282

565

Methyltransf_29

PF03141 Methyltransf_29 101-563 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795644.1`	Pfam	`PF03141`	Methyltransf_29	Family	129	598	7.4e-170	566.6	Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase
`XP_057795645.1`	Pfam	`PF03141`	Methyltransf_29	Family	101	563	3.7e-169	564.3	Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939661.1
ATGTAAAATAACCACTGGTCAACATGTCATGTAATTTTGAAAAAAAAAAAACTTATCAATTCAAATGTAAAATGTAATTCAACAAGTTCTACCCCTACGACATGAGCATGCATGCTAGCTACTTCTGGTTTGGAAACTCTGATACTTGTAATTCAGCGGAGAATCTCTGAGAGTACTCTTGCTTCTCTCTCCCTCACACACACACAATGAAAGGCAAGTGCACAAGCTCATCATCCACCATAACATTCATAAACACTGTA...

XM_057939662.1
ATGTAAAATAACCACTGGTCAACATGTCATGTAATTTTGAAAAAAAAAAAACTTATCAATTCAAATGTAAAATGTAATTCAACAAGTTCTACCCCTACGACATGAGCATGCATGCTAGCTACTTCTGGTTTGGAAACTCTGATACTTGTAATTCAGCGGAGAATCTCTGAGAGTACTCTTGCTTCTCTCTCCCTCACACACACACAATGAAAGGCAAGTGCACAAGCTCATCATCCACCATAACATTCATAAACACTGTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011813
ATGAAAGGCAAGTGCACAAGCTCATCATCCACCATAACATTCATAAACACTGTAGCTTTCCTCTCCCTCCTCTCCTTCTCTCTCTTCTTTCTCTCCAAACATTTCTCTGCACGCACCACATCCCCAGCTGAGCAGCTTTACTTCTTCAACTCCACCCACACAAACACCGCTCCCTCGCCCTCCGCGGCGGGGCCGGTGTTGGAGAGCACAGGGATCATAAATGAGTTCGGAATCATGACCTCTGATTTCATGGTTGGAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795644.1
MKGKCTSSSSTITFINTVAFLSLLSFSLFFLSKHFSARTTSPAEQLYFFNSTHTNTAPSPSAAGPVLESTGIINEFGIMTSDFMVGNFDEGLLQSVAAISNGEKVKRENDEGEVIRVERFRVCDVNMSDFVPSVSKGLDCLVPRPKGYKLPMPWPESRDQVWFDNIHYTPEDNEGRNRVSKKDDKLMFSGDGPKSDQNLDQMVPEIAFGQRTRVVLDVIGSGIANFGAYLMERNVTTLLIAGKDHAKQVQLALERGIPAM...

XP_057795645.1
MKGKCTSSSSTITFINTVAFLSLLSFSLFFLSKHFSARTTSPAEQLYFFNSTHTNTAPSPSAAGPVLESTGIINEFGIMTSDFMVGNFDEGLLQSVAAISNGLDCLVPRPKGYKLPMPWPESRDQVWFDNIHYTPEDNEGRNRVSKKDDKLMFSGDGPKSDQNLDQMVPEIAFGQRTRVVLDVIGSGIANFGAYLMERNVTTLLIAGKDHAKQVQLALERGIPAMVTTFGTRRLPFPSQAFDLIRCSRCGMNWALDDGVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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